clr中心对称对数比变换 CLR中心对称对数比变换是一种对多元正态分布数据进行处理的转换方法,常见于生物信息学和生态学领域。该方法可以将原始数据转换为对数比,且中心对称,用于降低不同变量之间的相关性,提高数据的分析效果。具体步骤为: 1.计算每个变量的几何平均数G,即样本每个变量的n个观测值的乘积的n次方根,...
在Python中,我们可以使用scipy库中的gmean函数来计算几何平均值,并使用numpy库中的log函数进行对数变换。下面是一个使用Python实现CLR中心对数比变换的示例代码: importnumpyasnpfromscipy.stats.mstatsimportgmean# 假设有一个3个特征的数据集data=np.array([[1,2,3],[4,5,6],[7,8,9]])# 计算每个特征的...
中心对数比变换(Centered Log-Ratio Transformation,简称CLR)和普通的对数比变换(Log-Ratio Transformation,简称LR)都是用于处理组成数据(Compositional Data,CoDa)的方法。在组成数据分析中,数据通常表示为比例或百分比,而这些数据的总和通常是固定的(如100%)。这样的数据具有特殊的几何和代数结构,需要特定的统计方法来正...