最近pfam 网站关闭了,合并到interporo里面,如果你要去找同源基因domain的编号和用hmmer筛选同源基因就要去interpro下载hmm文件。 Pfam is now hosted by InterPro1.打开interpro,点击pfam图标 InterPro (ebi.ac.…
由于pfam数据库需要翻墙才能正常搜索下载基因结构域的hmm文件,详情见:http://www.omicsclass.com/article/85 如果你知道自己要研究的基因家族的编号,示例: PF02171 通常以PF开头 请提供PF号,我们可以提供下载服务。注意:一次兑换只能下载一个编号对应的hmm文件。多个请再次兑换。 如果不知道自己研究的基因家族的pfam号...
ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/Pfam/releases/