Aspera是一款功能非常强大的文件传输软件,以fasp传输专利技术为核心,比传统的ftp快1000倍数,不受文件大小、传输距离或网络条件的限制。支持使用Web界面、客户端、命令行以及API进行输出,同时软件内置AES-128加密算法,传输过程中加密及落地加密,安全系数非常的高,能够保证你传输文件时的安全性。
在如图的步骤一中搜索BioProject或SRR编号(如:PRJNA812958或SRR18231894),找到所需的项目或SRA数据,点击“Show Column Selection”勾选sra_aspera信息,然后直接点击复制SRA Aspera下载地址,或者在步骤二中下载TSV文件获取SRA Aspera下载地址,其中最后一列的红色箭头即为Aspera下载地址信息。 如图所示,我们可以看到下载好PRJNA...
Aspera官方版是一款非常好用的文件传输软件,用这个软件传输文件会非常的快,而且这个软件的安全系数很高,不会让你的文件被盗。感兴趣的小伙伴快来下载吧! Aspera最新版介绍 Aspera软件以最快速度传输全球数据,不受文件大小、传输距离或网络条件的影响。解决方案的核心是 fasp传输专利技术,它是一项突破性传输协议,充分利...
下载链接: https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/release/viral/viral.2.1.genomic.fna.gz 需要去除前面的域名,用如下命令下载: ascp-i~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh-l100M-k1-Tanonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/refseq/release/viral/viral.2.1.genomic.fna.gz. ...
最近aspera下载受阻 曾健明 生物信息学菜鸟一枚1 人赞同了该文章 以前sratoolkit的prefetch命令下载sra文件速度太慢,所以我们建议大家参考:使用ebi数据库直接下载fastq测序数据 , 自行配置好aspera , 代码如下所示: conda create -n download conda activate download conda install -y -c hcc aspera-cli conda ins...
echo 'export PATH=~/.aspera/connect/bin:$PATH' >> ~/.bashrc source ~/.bashrc ascp --help 好了。 运行 先来看看ascp的参数吧 -T 不进行加密。若不添加此参数,可能会下载不了。 -i 输入私钥,安装 aspera 后有在目录 ~/.aspera/connect/etc/ 下有几个私钥,使用 linux 服务器的时候一般使用 ~/....
006、解决方法:下载低版本的aspera,重新安装 [liujiaxin01@PC1 aspera_old]$ wget -c https://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.8.3/ibm-aspera-connect-3.8.3.170430-linux-g2.12-64.tar.gz ## 下载3.8.3版本--2024-08-2111:32:39-- https://download.asperasoft.com/download/sw/connect...
asperaweb_id_dsa.openssh文件在.aspera/connect/etc/中 最好能够从网站直接下载aspera下载的脚本,在ebi的网站上能够找到,而如果下载NCBI是不行的,只能根据NCBI提供的session编号,如PRJNA/GSE/SRR/SRA等等来在EBI上再找到链接然后下载。 ascp -i asperaweb_id_dsa.openssh -P33001 era-fasp@fasp.sra.ebi.ac....
Aspera直接从EBI(European Bioinformatics Institute)的ENA(European Nucleotide Archive)数据库下载FASTQ格式文件,大大提升了下载速度。为了使用Aspera,小果推荐通过conda进行安装,步骤简单方便。安装后,通过EBI网站搜索所需的项目或SRR编号,获取Aspera下载链接。如果已有SRR号,可直接通过脚本批量下载FASTQ...
下载Aspera(win)链接:https://downloads./connect2/ 点击安装 这一块的教程,包括如何下载基因组数据,大家可以往前翻,看下之前的教程:手把手Aspera下载数据 今天教给大家利用Aspera如何下载SRA数据。 基因组数据等可以通过浏览器直接点击自动激发Aspera,进行下载。