总之,这些结果揭示了结构变异与三维基因组变异之间存在显著的相关性,但三维基因组变异的变化相对有限,这表明结构变异在三维基因组变异中起到了促进但非决定性的作用。 转座子插入是引发结构变异的重要因素。因此,我们研究了转座子在引发导致三维基因组变异的结构变异中的作用。对于大多数转座子元件,我们观察到ABA或PBA...
泛三维基因组是以Hi-C技术为核心,结合基因组及表观功能组学研究技术,对细胞核内的三维空间结构与基因功能和结构变异间的关系进行研究, 了解物种或疾病远距离互作和结构变异形成的空间基础与调控机制,实现对物种基因组的遗传机制和生物功能的深入挖掘。 “Hi-C技术开启了三维基因组生物学时代,被誉为技术突破与现有方法...
近日,中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜研究员团队在基因组学领域知名期刊Genome Biology发表了题为“Pan-3D genome analysis reveals structural and functional differentiation of soybean genomes”的研究论文,首次构建了大豆的泛三维基因组,揭示了大豆基因组、三维基因组和基因表达的内在联系。研究团队根据前期进...
泛三维基因组是以Hi-C技术为核心,结合基因组及表观功能组学研究技术,对细胞核内的三维空间结构与基因功能和结构变异间的关系进行研究, 了解物种或疾病远距离互作和结构变异形成的空间基础与调控机制,实现对物种基因组的遗传机制和生物功能的深入挖掘。 “Hi-C技术开启了三维基因组生物学时代,被誉为技术突破与现有方法...
理化学研究所于1月27日宣布,利用世界上最大规模的泛自闭症(ASD)家族基因序列数据,对新生的变异“de novo变异”进行了全面解析。研究结果表明,在基因上游控制其表达的“启动子区域”的de novo变异,会导致基因组三维结构(TAD)内的相互作用变化导致基因表达异常,从而对疾病风险造成影响。
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三维基因组在真核生物的发育过程和基因调控中起着重要作用。哺乳动物和果蝇中有清晰的基因组结构层级划分,且两者中分别存在由结构蛋白CTCF调控的拓扑相关结构域(topological associated domain,TAD),或由组蛋白修饰调节的区室结构域(compartment domain,CD)。植物中,特别是模式植物拟南芥中是否存在类似结构一直是...
主办方:诺禾致源2024-08-19 18:42 分享 简介 资料包百度网盘链接: https://pan.baidu.com/s/1ktVMrTP4ke3ksAcO_y8gDQ 提取码: jbrm
近日,中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜研究员团队在基因组学领域知名期刊Genome Biology发表了题为“Pan-3D genome analysis reveals structural and functional differentiation of soybean genomes”的研究论文,首次构建了大豆的泛三维基因组,揭示了大豆基因组、三维基因组和基因表达的内在联系。
理化学研究所于1月27日宣布,利用世界上最大规模的泛自闭症(ASD)家族基因序列数据,对新生的变异“de novo变异”进行了全面解析。研究结果表明,在基因上游控制其表达的“启动子区域”的de novo变异,会导致基因组三维结构(TAD)内的相互作用变化导致基因表达异常,从而对疾病风险造成影响。