我现在需要做基于多序列比对结果的一致性序列鉴定,我的思路是每一个序列纵向比对,如果全都是一样的字母,那么则说明这个纵向一致,如果这个纵向序列不全一样的化,则说明这个纵向没有一致,如果有连续超过100个字符的纵向一致列存在,那么打印出来所对应的这样的每一小段序列,这就是我想要的一致性序列,最终输出在一个...
序列相似性，又称之为similarity，它指的是两条比对序列中相似位点所占的比例。我们常说，a和b的序列相似性达到90%，就是指这两条序列中90%的位点是相似的。其计算公式为：相似度 = （一致及相似的字符数量 / 总长度）× 100%。这种相似性不仅体现在字符上，还包括残基的相似性，即相似的残基与相同的残基在...
在基因组序列分析中，序列一致性（Sequence Identity）是指在对比两个或多个核酸（如DNA或RNA）或蛋白质...
【答案】：B A项，TTGACA是原核生物基因中－35区的最大一致性序列。B项，原核生物基因中-10区一致性序列TATAAT，称为Pribnow盒。C项，真核生物转录起始前有典型的TATA序列称TATA盒或Hogness盒，是启动子的核心序列。D项，真核生物转录终止的修饰点有AATAAA和GT序列。
序列一致性 = 完全匹配数/(完全匹配数+碱基错配数) 在这个例子中,按照这个方法来计算的话,其序列一致性就是:43/(43+1) = 0.977,也就是这个两个序列之间有97.7%的一致性。 这个计算方式也是我们以前比较人类基因组和黑猩猩基因组一致性程度时,得到98.77%这个一致性值所采用的方法,在那篇黑猩猩基因组文章中,...
经常碰到需要计算一组 DNA 序列的一致性序列,比如去除测序数据中的 PCR 错误,最简单的方法就是通过计算它们之间的一致性序列。 图源:rosalind.info 计算一致性序列,通常借助一个中间矩阵,如上图的 Profile。我们可以沿着序列延伸的方向,计算每一个位点的 A、C、G、T 含量,从而得到一个用于计数的 Profile 矩阵,然...
解析 相似性和同源性:相似性(similarity)和同源性( homology)是两个完全不同的概念.同源序列是指从某一共同祖先经过趋异进化而形成的不同序列.相似性是指序列比对过程中检测序列和目标序列之间相同碱基或氨基酸残基序... 分析总结。 相似性是指序列比对过程中检测序列和目标序列之间相同碱基或氨基酸残基序...
解析 TTGACA 原核生物的启动子区域包含两个重要的保守序列,即-10区和-35区。-10区的一致性序列为TATAAT(Pribnow盒),而-35区的一致性序列通常为TTGACA,这一区域在RNA聚合酶的识别和结合中起关键作用。题目询问的是-35区的保守序列,因此正确答案为TTGACA。无需选项分析,题目直接指向确定知识点。
(2015年第36题)原核生物转录起始点上游一10 区的一致性序列是 A. Pribnow盒 B. GC盒 C. UAA D. TTATTT 答案: A 分析: 正确答案:A 解析:原核生物转录起始点上游一10区的一致性序列TATAAT,又称为Pribnow盒。GC盒是真核基因启动子的特征序列。UAA是mRNA上的终止密码子。 知识模块:基因信息的传递...
【答案】：A 原核生物转录起始点上游－10区的一致性序列TATAAT，是1975年由D.Pribnow首先发现的，故称为Pribnow盒。GC盒是真核生物基因的转录起始启动子的上游元件。