转录起始点(TSS):转录时,mRNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基,通常为一个嘌呤。 UTR(Untranslated Regions):即非翻译区,是信使RNA(mRNA)分子两端的非编码片段。 5'-UTR从mRNA起点的甲基化鸟嘌呤核苷酸帽延伸至AUG起始密码子,3'-UTR从编码区末端的终止密码子延伸至多聚A尾巴(Poly-A)的末端。 1查找基因的...
启动子(promoter):与RNA聚合酶结合并能起始mRNA合成的序列。 转录起始点(TSS):转录时,mRNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基,通常为一个嘌呤。 UTR(Untranslated Regions):即非翻译区,是信使RNA(mRNA)分子两端的非编码片段。 5'-UTR...
启动子(promoter):与RNA聚合酶结合并能起始mRNA合成的序列。 转录起始点(TSS):转录时,mRNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基,通常为一个嘌呤。 UTR(Untranslated Regions):即非翻译区,是信使RNA(mRNA)分子两端的非编码片段。 5'-UTR从mRNA起点的甲基化鸟嘌呤核苷酸帽延伸至AUG起始密码子,3'-UTR从编码区末端的...
启动子(promoter):与RNA聚合酶结合并能起始mRNA合成的序列。 转录起始点(TSS):转录时,mRNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基,通常为一个嘌呤。 UTR(Untranslated Regions):即非翻译区,是信使RNA(mRNA)分子两端的非编码片段。 5'-UTR从mRNA起点的甲基化鸟嘌呤核苷酸帽延伸至AUG起始密码子,3'-UTR从编码区末端的...
1. 查找基因的启动子区域-NCBI 1. 打开PubMed:/pubmed 2. 选择Gene,输入IL17A,点击search,结果如下图,点击第一个: 3. 下拉到下图位置,可以看到该基因的以下信息: 点击Tools,选择Sequence Text View: 还可以看到如下序列信息: 4. 以上只是该基因的一些信息,可以用于查找相应的UTR等区域,下面进入正题,寻找promot...
转录起始点(TSS):转录时,mRNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基,通常为一个嘌呤。 UTR(Untranslated Regions):即非翻译区,是信使RNA(mRNA)分子编码区(CDS)两端的非编码片段。5’-UTR从mRNA起点的甲基化鸟嘌呤核苷酸帽延伸至AUG起始密码子,3’-UTR从编码区末端的终止密码子延伸至多聚A尾巴(Poly-A)的末端。
1. 查找基因的启动子区域-NCBI 1. 打开PubMed:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed 2. 选择Gene,输入IL17A,点击search,结果如下图,点击第一个: 3. 下拉到下图位置,可以看到该基因的以下信息: 点击Tools,选择Sequence Text View: 还可以看到如下序列信息: ...
登录PubMed: ncbi.nlm.nih.gov搜索基因，如IL17A，查看搜索结果并点击第一条。在Gene页面，选择Sequence Text View，查看基因的上游2 kb序列，即为其启动子区域。UCSC查找启动子区域 访问UCSC: genome.ucsc.edu，使用Table Browser获取基因的上游2000 bases的序列，即启动子区域。对于转录因子结合位点的...
基础知识 首先我们了解一些基础知识(注:文中图片皆可点击放大查看!): 启动子(promoter):与RNA聚合酶结合并能起始mRNA合成的序列。做生信分析时,一般选择上游1 kb,下游 500 nt,也有选上下游各1 kb的。如果关注核心启动子,可见生信宝典之前发布的Jaspar数据库...
查找基因的启动子区域-NCBI 1. 打开PubMed:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed 2. 选择Gene,输入IL17A,点击search,结果如下图,点击第一个: 3. 下拉到下图位置,可以看到该基因的以下信息: 点击Tools,选择Sequence Text View: 还可以看到如下序列信息: ...