图1:ATAC-seq原理示意图 2 环境安装与数据下载 我选择要重复的是2018年发表在plant journal上的关于拟南芥ATAC-seq的一篇文章,其题目为:《Changes in chromatin accessibility between Arabidopsis stem cells and mesophyll cells illuminate cell type-specific transcription factor networks》。该文章对拟南芥茎尖分生组织...
首先，我们要分析拟南芥干细胞和叶肉细胞的ATAC-seq数据，为了保证环境一致性，我们将在独立的conda环境atac_test中操作。对于新手，我会特别强调软件安装的便捷工具，例如使用“软件管家”。环境创建和数据下载是基础，我们将在Windows上利用Linux子系统进行，具体如下：创建并激活环境：conda create -n atac...