表征Pi-Pi堆积的物理量一般使用两个, 距离和角度. 距离为某一组原子质心或中心到另一组原子所在平面的距离, 角度为两组原子所在平面之间的夹角. 计算这两个量就需要知道如何计算一组原子所在平面的方程. 对于完全刚性的平面组原子, 三个非共线原子就可以确定其所在的平面方程(平面的三点式方程). 对于近似刚性的...
作为新手小白，求教更详细的计算Pi-Pi堆积距离和堆积角度的教程，或者可以解决我用vmd出现的上述两个问题...