可以用--hap-r2 --geno-r2 or --geno-chisq。因为是两两比较,比较耗费时间,建议用--ld-windows --ld-windows-bp or --min-r2去减少比较的次数。 1 vcftools --vcf test.vcf --hap-r2 --ld-window-bp 500000 --out ld_windows_500000 Getting Fst population statistics 必须提供text文件,每行一个个...
原因1:IP地址有问题,利用windows ping Linux的IP发现是可以ping上的,故排除 原因2:远程登录未开启 #首先切换到root用户,之后修改config文件 vi /etc/ssh/sshd_config #在这个文件中找到以下内容 找不到可直接添加 PermitRootLogin yes StrictModes no PasswordAuthentication yes ...
2019-12-19 11:20 −Demo 跑起来之后,就需要根据具体的负载和日志进行优化了,本次主要是优化在 Kibana 界面中 [Table] 展开的 Patterns,过多的 Patterns 有几个负面作用:1)、干扰查看信息2)、增大索引占用空间3)、降低 es 的写入性能 ELK各组件版本:(Windows Server... ...
建议不要用记事本编辑文件，可能出现linux和windows编码问题导致错误，用notepad++
mahmuttcommentedJan 20, 2022 When I setup the program on windows or macOS I am meeting this warning./autogen.sh: line 3: autoreconf: command not found 👍1leshaker reacted with thumbs up emoji 👍 taishudayocommentedFeb 1, 2022
2019-11-12 21:05 −㈠定义 cmd是command的缩写.即命令提示符(CMD),是在OS / 2 , Win为基础的操作系统(包括Windows 2000和XP中, Vista中,和Server 2003 )下的“MS-DOS 方式”。中文版Windows XP 中的命令提示符进一步提高了与D... 石海莹
--window-pi <integer> --window-pi-step <integer> Measures the nucleotide diversity in windows, with the number provided as the window size. The output file has the suffix ".windowed.pi". The latter is an optional argument used to specify the step size in between windows. OUTPUT FST ...
non-linux users are encouraged to useKitematic, which provides a Docker installation forOSXorWindows, coupled with a user friendly interface to run Docker containers; linux users and people familiar with the command line can follow the instruction on installing Docker from itswebsite. ...
vcftools --vcf test.vcf --hap-r2 --ld-window-bp 500000 --out ld_windows_500000 Getting Fst population statistics 必须提供text文件,每行一个个体(同一个population)。使用–weir-fst-pop进行Fst计算。 vcftools --vcf test.vcf --weir-fst-pop population1.txt --weir-fst-pop population2.txt --ou...