input可以为VCF或BCF格式(--vcf --gvcf or --bcf)。 1 2 vcftools --vcf test.vcf less test.vcf | vcftools --vcf - Applying a filter 可以把筛选的突变写入一个新文件。--recode表示输出筛选的内容,--recode-INFO-all保留所有的INFO fields的内容。default情况下,INFO fields不写,因为筛选会改变文件里...
gvcftools是用于创建和分析gVCF文件的小型实用程序包。每个实用程序的说明如下: gatk_to_gvcf使用GATK Unified Genotyper修改版的“所有站点”输出创建gVCF。 trio枚举父子三重奏的继承冲突和其他统计信息。 twins枚举两个样本之间的基因型冲突和其他统计信息,通常是技术重复样本或单卵双胞胎。 break_block...
VCFtools用来处理VCF文档。筛选特定突变比较文件总结突变转化文件格式验证并合并文件取突变交集和差集Get basic file statisticsinput可以为VCF或BCF格式(--vcf --gvcf or --bcf)。vcftools--vcf test.vcf less test.vcf |vcftools--vcf -Applying a filter可以 ...
nohup vcftools --gzvcf rice.raw.vcf.gz --recode --recode-INFO-all \ --stdout --maf 0.05 ...
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2019-01-28 19:11 −VCFtools用来处理VCF文档。 筛选特定突变 比较文件 总结突变 转化文件格式 验证并合并文件 取突变交集和差集 Get basic file statistics input可以为VCF或BCF格式(--vcf --gvcf or --bcf)。 vcftools --vc... 望着小月亮 0