bcftools软件在处理vcf文件时,某些情况下会优于vcftools,合并vcf文件的命令如下。 bcftools concat concat-a.vcf concat-b.vcf -o combine_a_b_samesample_diffsites_bcftools.vcf 合并之后的vcf文件位点信息与其余两款软件处理结果一致,只不过在输出结果的header中会出现运行的命令,示例如下。 ##bcftools_concatVersio...
可以使用-o选项指定输出文件的路径和名称。 5.示例:以下是使用vcftools进行简单的VCF文件合并的示例命令: ```bash vcf-merge ``` 该命令将和两个文件合并为一个名为的文件。 以上是vcftools的使用手册,具体使用方法和参数选项可以参考官方文档或使用命令行帮助命令获取。
bcftools软件在处理vcf文件时,某些情况下会优于vcftools,合并vcf文件的命令如下。 bcftools concat concat-a.vcf concat-b.vcf -o combine_a_b_samesample_diffsites_bcftools.vcf 合并之后的vcf文件位点信息与其余两款软件处理结果一致,只不过在输出结果的header中会出现运行的命令,示例如下。 ##bcftools_concatVers...
lst=$( awk '{a=a" "$1".raw.snv_indel.vcf.gz";}END{print a}' A.sample.lst B.sample.lst ) #echo $lst bcftools merge -Ov -o all_sample.merge.vcf $lst 转plinkvcftools --vcf all_sample.merge.allele.uniq.vcf --plink --out snp_indel plink --file snp_indel --allow-no-sex ...
GCC编译过程:a.c ->预处理-> a.i ->汇编-> a.s ->编译-> a.o ->链接-> a.outgcc -E -o a.i a.c (预处理)gcc -S -o a.s a.i (编译)gcc -c -o a.o a.s (汇编)g... i0gan 0 436 源码安装gcc 2019-12-14 11:33 − [toc] ## gcc版本网站 http://ftp.gnu.org...
1,编译安装 git clone https://github.com/vcftools/vcftools.git cd vcftools bash ./autogen.sh ./configure make make install 1. 2. 3. 4. 5. 6. make 报错: g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../.. -g -O2 -MT vcftools-bcf_entry.o -MD -MP -MF .deps/vcftools-bcf_entry.Tpo -c -o ...
libmcrypto libmemcache libmemcached libmicrohttpd libmikey libmirage libmkv libmnetutil libmodbus libmodelfile libmodman libmonetra libmongo-client libmorph libmrss libmsip libmspack libmstun libmsv libmt_client libmutil libmwaw libmxp libnatpmp libnatspec libnemesi libnfs libnfsidmap libngf lib...
o checking whether we are using the GNU C++ compiler... yes checking whether g++ accepts -g... yes checking for style of include used by make... GNU checking dependency style of g++... gcc3 checking for gcc... gcc checking whether we are using the GNU C compiler... yes checking ...
1,编译安装 代码解读 git clone https://github.com/vcftools/vcftools.git cd vcftools bash ./autogen.sh ./configure make make install 1. 2. 3. 4. 5. 6. make 报错: 代码解读 g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../.. -g -O2 -MT vcftools-bcf_entry.o -MD -MP -MF .deps/vcftools-bcf_ent...
1,编译安装 代码解读 git clone https://github.com/vcftools/vcftools.git cd vcftools bash ./autogen.sh ./configure make make install 1. 2. 3. 4. 5. 6. make 报错: 代码解读 g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../.. -g -O2 -MT vcftools-bcf_entry.o -MD -MP -MF .deps/vcftools-bcf_ent...