进入官网（https://www.uniprot.org/），可以看到数据库页面分为上下两部分，上半部分为搜索框（图1），下半部分则是数据库和分析工具，也是本期主要介绍的内容。一、UniProt数据库构成 目前，UniProt主要由以下子库构成：1. UniProt Knowledgebase（UniProtKB）该数据库由Swiss-Prot和TrEMBL两个数据库构成。Swiss-P...
sp:Swiss-Prot数据库简称 Q12888:UniProt ID号 TP53B_HUMAN:UniProt登录名 TP53-binding protein 1:蛋白质名称 OS=Homo sapiens:Organism简称,表示人类蛋白质 OX=9606:Organism Taxonomy,物种分类数据库Taxonomy ID GN=TP53BP1:Gene name,基因名为TP53BP1 PE=1:Protein Existence,蛋白质可靠性,数字越小越可靠: ...
3、Subcellular Location 亚细胞定位 该版块提供有关细胞中成熟蛋白的位置、拓扑结构和跨膜等相关信息。4、Disease & Variants 疾病&变体 该板块主要提供相关疾病、表型等信息。5、PTM/Processing 蛋白翻译后修饰/加工 该版块提供信号肽、肽链和蛋白修饰等相关信息。6、Expression 表达 表达版块下提供基因在细胞或多细胞...
一、UniProt 数据库介绍 Uniprot (Universal Protein)是包含蛋白质序列,功能信息,研究论文索引的蛋白质数据库,整合了包括EBI( European Bioinformatics Institute),SIB(the Swiss Institute of Bioinformatics),PIR(Protein Information Resource)三大数据库的资源。
1.1 Uniprot UniProt(Universal Protein Resource,https://www.uniprot.org/)是一个免费开放的综合性蛋白质数据库。该数据库蛋白信息来源于EMBL、GenBank、DDBJ等公共数据库(非冗余蛋白质序列数据库),目前使用频率非常高,包含信息非常全面。该数据库主要提供了蛋白质序列和丰富的功能注释信息,用途多样,是查询蛋白功能和...
Uniprot数据的使用 1. 单个蛋白质信息查询 下图是Uniprot官方网站首页,在UniprotKB栏输入蛋白ID或Accession number,然后点击search,就可以查询蛋白功能。 我们以高粱基因SORBI_3008G150300为例,搜索其在Uniprot数据库中的信息,如下图,页面默认显示Entry模式,页面显示内容包括:蛋白名称、物种来源、GO功能注释、亚细胞定位、...
登陆uniprot官方网站(http://www.uniprot.org/,见截图)即可看到,目前uniprot网站收录的sp数据库有554241条蛋白条目,tr数据库有84827567条。当然这一数据每天都有更新。更多数据库参考信息相关链接:http://www.uniprot.org/help/uniprotkb 好啦,小编今天就说到这儿,是不是感觉意犹未尽呢~别急,APT会逐步给老师同学...
做蛋白质研究的你,如果还不会用Uniprot,说明还太年轻。抓紧陪我一起变“老”吧..., 视频播放量 2146、弹幕量 1、点赞数 11、投硬币枚数 2、收藏人数 53、转发人数 6, 视频作者 华盈生物-测蛋白, 作者简介 ,相关视频:这个小洞就是子宫颈,它是女生身体中非常重要的一个结
首先打开官网主页:www.uniprot.org/,搜索栏输入IL-6,点击Search或键盘回车,然后左侧栏选择Human Entry:Uniprot给每个蛋白质赋予的ID(由此进入查看具体信息) Entry name:蛋白ID的简要名字 Protein names:蛋白质的名字 Gene names:编码这个蛋白的Gene名字 Organism:蛋白质的种属来源 ...
Uniprot数据库是Universal Protein的英文缩写,是信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库。我们常用的是UniProtKB。UniProt knowledgetbase (UniProtKB)是收集蛋白质功能信息的中心枢纽,拥有准确、一致和丰富的注释。除了为每个 UniProtKB 条目捕获必需的核心数据(主要是氨基酸序列、蛋...