另外,trim_galore还会在处理后生成相应的输出文件,命名规则通常是在原始文件名的基础上添加一定的标识来表示经过质量控制和修剪后的文件,比如在文件名末尾添加"_trimmed"或者"_val_1"、"_val_2"来表示成对的数据经过修剪后的文件等等。 总的来说,trim_galore的命名规则是基于原始文件名并根据处理过程和参数添加特定...
--length:设定输出reads长度阈值,小于设定值会被抛弃。--paired:对于双端测序结果,一对reads中,如果有一个被剔除,那么另一个会被同样抛弃,而不管是否达到标准。--retain_unpaired:对于双端测序结果,一对reads中,如果一个read达到标准,但是对应的另一个要被抛弃,达到标准的read会被单独保存为一个文件。--gzip和-...