$ tar -zxvf tophat-2.1.0.Linux_x86_64.tar.gz 加入PATH 即可 $export PATH=/home/maque/tophat-2.1.0.Linux_x86_64/:$PATH 测试 $ tophat2 应该就看到各种信息,包括版本,基本用法等,这样 tophat2 就算安装完成了。
首先要安装bowtie或bowtie2 conda install -y bowtie2 bowtie2 -h #检查是否安装成功 安装tophat2 安装 wget ccb.jhu.edu/software/to 解压 tar -zxvf tophat-2.1.1.Linux_x86_64.tar.gz 加入PATH(此时的路径应符合你安装的路径) export PATH=/home/tophat-2.1.1.Linux_x86_64/:$PATH 测试 tophat...
首先利用conda安装bowtie2：conda install -y bowtie2 检查安装情况：bowtie2 -h 若成功安装，应无报错信息。若未安装bowtie2，先进行下载：wget ccb.jhu.edu/software/to...解压下载的文件：tar -zxvf tophat-2.1.1.Linux_x86_64.tar.gz 将解压的tophat添加至PATH环境变量中：export PATH=/...
tophat2和cufflinks安装:tophat2和cufflinks都是很重要RNA-SEQ处理的软件。 tophat2和cufflinks的安装也是相当简单的。(由于tophat2和cufflinks针对linux和Mac有编译好的二进制文件,所以不需...文字版>> http:...
本人原来下了并且安装了tophat2,但是觉得自己的虚拟机硬盘不够大,便重新建立了一个虚拟机并重新安装了tophat2。但是,这次安装我却遇到了许多问题 1.从官网上面直接下载并安装tophat2,再配置好环境变量后,运行tophat2出现如图所示的问题 NO04@0`K`UN6I4N0_E~@HYE.png ...
tophat2{官网下载} 首先安装好bowtie2 下载地址:http://sourceforge.net/projects/bowtie-bio/files/bowtie2/ 下载(最新版本的) 解压:unzip bowtie2-2.3.3-linux-x86_64.zip cd bowtie2-2.3.3-linux-x86_64 (由于这个已经是编译好的) (将bowtie2 bowtie2-build bowtie2-inspect拷贝到你安装目录下的...
情况一:tophat2必须在python2.7下安装,选择在conda内创个小环境即可: 安装tophat2 ##下载 wget http://ccb.jhu.edu/software/tophat/downloads/tophat-2.1.0.Linux_x86_64.tar.gz ##解压 tar -zxvf tophat-2.1.0.Linux_x86_64.tar.gz ##加入环境变量path ...