计算TMscores需要使用专门的软件和算法,例如TM-align或TM-score。这些软件使用不同的方法来比较两个蛋白质结构的相似性。一般而言,计算TMscores的步骤包括: 1.蛋白质结构的预处理:这包括去除水分子、离子和其他杂质,使蛋白质结构更加纯净。 2.提取蛋白质结构的特征:这种特征可以是氨基酸的空间坐标、二面角等。 3.对...
相对于 LG-score,MaxSub 去掉了未匹配残基的空位罚分(gap penalty),并且去掉了无用的常数 M,代之以 1/LN,从而在优化过程中需要最大化地重合两个比较结构的子结构,只考虑对齐后 di ≤ d0 的残基,尽可能地增加 LT;相对于 MaxSub,TM-score 则将常数 d0 替换为一个 LN 的函数,从而使得整体打分没有链长依...
向上滑动阅览 Overall Score 换算表 由于篇幅限制,此处展示部分TMUA的past paper,便于大家有直观了解。 TMUA Paper 1 向上滑动阅览 图片来源 CAAT官网 TMUA Paper 2 向上滑动阅览 图片来源 CAAT官网 04 TMUA 考察内容与难度分析 TMUA ...
TM-score是tmalign中最重要的指标之一,用于衡量两个蛋白质结构的相似性。TM-score基于实验观测到的结构中的原子坐标来计算两个结构之间的相似性。它通过对比两个结构的排列方式和残基之间的连接,来判断它们之间的相似程度。TM-score的取值范围在0到1之间,值越接近1表示两个结构之间越相似。 tmalign的比对结果不仅仅...
Overall Score 换算表 由于篇幅限制,此处展示部分2022年TMUA的past paper,便于大家有直观了解。 TMUA Paper 1 图片来源 CAAT官网 TMUA Paper 2 图片来源 CAAT官网 04、TMUA 考察内容与难度分析 TMUA Paper 1考察数学知识的应用,涵盖知识点包括:代数和函数、数列和级数、平面坐标几何、三角函数、指数和对数、微分...
研究内容 本研究旨在基于tm模型的基础上，对主动型股票基金的择时能力进行分析。具体研究内容包括：tm模型的原理及构建方法、数据采集与处理、模型计算与结果分析等。研究方法 本研究采用理论分析与实证研究相结合的方法，首先对tm模型进行理论阐述，然后通过采集市场上主动型股票基金的净值数据，进行实证研究。研究创新点与...
Overall Score 换算表 👆总分换算表 所以TMUA要求申请者有较为仔细严谨的答题习惯,在做题过程中要尽可能减少低级失误。笔试中不提供公式表,也不允许使用计算器。因此建议大家可以在准备过程中注意加强计算能力,巩固熟悉基础知识,以求考试效...
Overall Score 换算表 ?总分换算表 所以TMUA要求申请者有较为仔细严谨的答题习惯,在做题过程中要尽可能减少低级失误。笔试中不提供公式表,也不允许使用计算器。因此建议大家可以在准备过程中注意加强计算能力,巩固熟悉基础知识,以求考试效率的最大化。 TMUA Paper 1侧重考察对数学学科不同基础知识点的掌握,例如等差...
4.1)采用蛋白质结构比对工具TM-align,依次计算每个单域蛋白和模板蛋白之间的比对得分,记录为TM-score<Sub>1</Sub>,TM-score<Sub>2</Sub>,...,TM-score<Sub>n</Sub>,其中>n</Sub>是第n个单域蛋白和模板蛋白之间的比对得分,n为单域蛋白的总个数; 4.2)以步骤3.1)中单域蛋白比对最高的得分为该模板的局...
6.2.5)采用tm-align计算排序第二的单域蛋白与最后一个比对点之后的模板蛋白的全局比对得分gtm-score2; 6.2.6)根据步骤6.2.1)-6.2.5)依次计算排序第三到第n的单域蛋白与模板的全局比对得分gtm-score3,gtm-score4,…,gtm-scoren; 6.2.7)计算按照该顺序进行模板全局评价的全局比对得分其中wi为排序为第i的单域...