打开Plant TF Binding Motif Shift 插件,设置苹果的蛋白序列全集,设置输出文件路径前缀,点击 Start 即可 等待即可(由于是几万个蛋白序列比对到几万个蛋白序列,如果是一般笔记本,BLAST的话,可能需要跑一整个晚上,但这个是值得的,因为一个物种一般就跑一次就好了。BLAST到底还是会比DIAMOND这类准确一些,在小细节上;当然...
今天想带大家来学习 networkanalyst 这个网站的使用方法,那这个网站可以用来分析 TF -gene、 TF 与 miRNA ,gene-miRNA,protein-chemical 等等它们之间的相互作用。我们还是来先看一下文件里,那这个文件它就是用 networkanalyst分析了 TF -gene以及TF-mRNA,你会发现它这个下面有给到你它的筛选的一个数值是多少。...
接着,选择TF-gene Interaction database,我们这里选择JASPAR数据库用于转录因子的预测。 很快,TF-gene的互作网络就完成了构建,如下,点击SIF,可下载sif格式的网络图文件导入到Cytoscape中进行分析和展示。 继续点击Proceed按钮,我们可以预览构建的TF-gene互作网络,默认的效果如下。 当然,我们也可以将网络图的背景调成白色...
通过LncRNA-TF-Gene Tripet可以检索对应的调控网络,检索框如下所示 选择肿瘤类型,然后输入lncRNA, TF, Target gene中的任意一个都可以,以PVT1这个lncRNA为例,检索结果如下 每一行代表一个lncRNA-TF-gene三角关系对,点击Network按钮,可以查看对应的网络图,示意如下 点击more按钮,可以查看详细信息,包括lncRNA,TF, ...
首先,在Bing中搜索networkanalyst,进入网站后选择genelist,输入目标物种(人或鼠)。分析基因时,可以选择基因ID或gene symbol,然后上传数据。在设置中,你可以根据文献选择合适的参数,如TF-gene分析的默认设置。对于复杂网络,可以调整节点和边的数量,以及degree筛选,最终得到初步的网络视图。这些初步图像...
型号:AAEON TF-GENE-5315-A10 CPU 控制原理:国外库存商品 加工定制:是 用途:工控卡件模块 量程:9780 度:0.0001 规格尺寸:5500mm 牌品:AB 产地:国外库存 品名:国外好库存 运输:货款交付后三天内发货 包装:AMAT 0040-78250 AAEON TF-GENE-5315-A10
此工具通过整合基因组广泛的转录调控与配对的lncrna和基因表达谱显示转录与其调节的靶基因以及lncrna网络关系 科研时间:LncRNA-TF-Gene网络通路的构建 在这里,我们提出了一个在线的构建LncRNA-TF-Gene网络工具-LncMAP。 此工具通过整合基因组广泛的转录调控与配对的lncRNA和基因表达谱,显示转录与其调节的靶基因以及lnc...
答案解析 查看更多优质解析 解答一 举报 TF是转录因子,调控转录产物的,可以是mRNA,也是非编码RNA(例如miRNA),也可是其他.miRNA也可以作用于mRNA,影响mRNA的表达.反正,应该是一个调控的网络. 解析看不懂?免费查看同类题视频解析查看解答 相似问题 任意miRNA可以与任意的mRNA的3'UTR区结合么 miRNA对植物和动物的mRNA...
TF-GENE-6315-A10-01 产品详情 The TF-GENE-6315-A10-01 parts manufactured by AAEON are available for purchase at Jotrin Electronics. Here you can find various types and values of electronic parts from the world's leading manufacturers. The TF-GENE-6315-A10-01 components of Jotrin Elect...
AAEONTF-GENE-LN05-A10-01 提交询价 遗憾的是,我们不知道TF-GENE-LN05-A10-01的任何分销商。如果您有已知的分销商,请告知我们,以便我们将其添加到数据库中,或向我们的合作伙伴之一询价。 向一些专门寻找罕见零件的分销商提交询价。 制造商别名 AAEON在全球拥有多个品牌,分销商可将其用作替代名称。AAEON 也可...