SVM-RFE算法演示 为了演示SVM-RFE在R语言中的应用,我们首先生成一组模拟的医学数据,包含40个特征和100个样本,其中20个样本为健康组,80个样本为疾病组。 # 生成模拟数据set.seed(123)n<-100p<-40data<-data.frame(matrix(rnorm(n*p),n))colnames(data)<-paste("Gene",1:p,sep="")data$Group<-c(rep(...
SVM-RFE matlab代码 functionr=SVMRFE(label,data) %SVM-RFE %SVMRecursiveFeatureElimination(SVMRFE) %byliyang@BNUMath %Email:patrick.lee@foxmail.com %lastmodified2010.09.18 %% n=size(data,2); s=1:n; r=[]; iter=1; while~isempty(s) %ifmod(iter,10)==0 %str=['===',num2str(iter),...
【24】代码分享│机器学习-支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)的构建 【25】代码分享│R可视化:对两个矩阵进行相关性可视化分析 【26】GEO数据库多数据集差异分析整合利器RRA,再也不用纠结去除批次效应 【27】你与生信大佬的距离,只差2分钟搞定预后模型构建和性能评估 【28】9+SCI纯生信,模型构建中的“流量明星”,...
因此,本代码SVM-RFE就是在癌症分类预测时用于标志物特征提取。 设置参数少,只需要输入有分类信息的基因表达数据,代码将自行执行序列后向选择算法,对每个特征进行得分进行排序并输出格式为CSV表格,同时还可以绘制特征的真实值和错误率变化曲线图。 使用方法: RscriptSVMRFE.R -input= 参数说明: USAGE: SVMRFE.R-inp...
本文探讨了利用余弦相似度算法实现文章自动摘要的方法，该方法通过对文章分句并计算余弦相似度，从而找出与...
2,…n]Featurerankedlistr=[]SVMRFE Repeatuntils=[]X=X0(:,s)a=SVM-train(X,y)w=akykxkci=(wi)2,forallif=argmin(c)r=[s(f),r]s=s(1:f-1,f+1:length(s))End SVMModel Minimizeoverak:J(1/2)yhykahak(xhxkhk)ak hkk Subjectto:0akC ...
基于支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)的回归数据特征选择算法,matlab代码,输出为选择的特征序号 ```评价指标包括:R清平**平调 上传271KB 文件格式 zip 支持向量机 matlab 基于支持向量机递归特征消除(SVM_RFE)的回归数据特征选择算法,matlab代码,输出为选择的特征序号。 评价指标包括:R2、MAE、MSE、RMSE和MAPE等,代...
该代码实现了一对一的SVMRFE算法 主要是用于特征选择 算法速度快 是SVMRFE的改进版本 代码片段和文件信息 function r = SVM_RFE(label data) % SVM-RFE % SVM Recursive Feature Elimination (SVM RFE) % by liyang @BNU Math % Email:patrick.lee@foxmail.com % last modified 2010.09.18 numclass=size(...
最终小果顺利完成了利用 lassso回归和SVM-REF两种机器学习算法进行了特征基因筛选,小伙伴们多多理解代码的意义哦~ 往期推荐 1.搭建生信分析流水线,如工厂一样24小时运转Snakemake——进阶命令 2.比blast还优秀的序列比对工具?HMMER来了 3.对单细胞分析毫无头绪?让popsicleR领你入门 ...