STARR seq是如何工作的? 增强子是能与TF转录组因子结合、增强基因转录效率、不受方向和距离影响的DNA序列。 DNA可及性、组蛋白修饰、转录因子、辅因子结合可用来表征增强子,但不能直接证明增强子功能以及量化增强子活性。 由于增强子活性与潜在的DNA序列直接相关,可通过深度测序在细胞RNA中测量结果报告转录物的存在。 具...
根据用于生物体内检测的STARR-seq系统的STARR-seq系统的input和output文库测序数据,分析定位增强子,并且对增强子活性进行分析。 1、利用30人混池DNA对4570个SNP进行基因组捕获,基因组片段大小约300bp,捕获文库分别同源重组至现有技术提供的AAV-ORI-STARR-seq质粒骨架和本申请实施例提供的AAV-ITR-STARR-seq质粒骨架上,形...
iSTARR-seq iSTARR-seq是南方科技大学牛见龙博士于2020年10月21在bioRxiv上发表的文章中提出的一种STARR-seq的改进方法。 南方科技大学牛见龙博士于2020年10月21在bioRxiv上发表的文章中指出:STARR-seq在拟南芥(a . thaliana)细胞中存在严重的系统错误,大量的自转录本(STs)在逆转录过程中丢失,因为这些STs在检测...
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2、平台质粒以模板价格出售,只保证基因部分测序正确,不保证质粒的实验效果;3、某些载体即使是出品公司亦没有完整测过序,如测序序列和原始参考序列有99%相同,亦认为是正确载体;4、我们的产品保质期为您收到产品之日起3个月,收到质粒后请及时转化操作,过期需重新购买;5、质粒构建皆收取的是成本费用,所有质粒会分享...
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