这次我们展示的是应用案例,利用GENEVESTIGATOR对Smart-Seq RNA-Seq数据集进行分析。整理工作包括数据处理、质量控制、(亚)聚类、细胞类型鉴定和跨研究协调、元数据(metadata)注释以及整合到可视化平台中。 案例情况: GEO accession: GSE113973 Smart-seq2技术,单细胞水平 来自模拟/健康小鼠和多发性硬化症小鼠模型的脊髓细...
利用GENEVESTIGATOR对Smart-Seq RNA-Seq数据集进行案例分析，整理了从数据处理到质量控制、（亚）聚类、细胞类型鉴定和跨研究协调、元数据注释及整合到可视化平台的流程。案例基于Falcão等人的研究，该研究分析了在多发性硬化中特定的寡核苷酸谱。通过协同其他神经病学研究并应用Immunai的细胞类型参考文献...