2.6万 15 13:00 App SIMCA14.1的基本操作(包含p值、vip值、置换检验等) 2238 -- 15:39 App 电子鼻数据分析 1981 -- 7:49 App SIMCA14.1【统计分析与多元变量数据处理】(PCA、HCA、OPLS-DA等)安装教程 2466 -- 25:05 App SIMCA14.1的使用辅助指导 浏览...
为了检验OPLS-DA有无过拟合,进行随机分组200次的置换检验。 VIP数值已导出,按照常规筛选差异物方法VIP>1 P<0.05,那还需要进行Students’t-test分析,获得P值,SIMCA也可以进行相应的分析,具体如下: 首先开启Omics skin功能(File-Options-Simca options-Skins-Enable Omics skin-Yes)。 第二步在Omics skin模式下进行...
为了检验OPLS-DA有无过拟合,进行随机分组200次的置换检验。 VIP数值已导出,按照常规筛选差异物方法VIP>1 P<0.05,那还需要进行Students’t-test分析,获得P值,SIMCA也可以进行相应的分析,具体如下: 首先开启Omics skin功能(File-Options-Simca options-Skins-Enable Omics skin-Yes)。 第二步在Omics skin模式下进行...
为了检验OPLS-DA有无过拟合,进行随机分组200次的置换检验。VIP数值已导出,按照常规筛选差异物方法VIP>1 P<0.05,那还需要进行Students’t-test分析,获得P值,SIMCA也可以进行相应的分析,具体如下: 首先开启Omics skin功能(File-Optio
实验数据导入后，预处理后的数据可供导入SIMCA进行分析。PCA模型中，Scaling方式包括Ctr（数据中心化）、UV（标准化）和Par（保留原始测量数据的方差）。选择合适的Scaling方式有助于更好地理解数据分布。OPLS-DA分析中，我们通过置换检验检查过拟合，并利用VIP值和Student's t-test进行差异物筛选。Omics ...
A: OPLS-DA后的数据有没有价值进⼀步往下分析，可以根据置换检验的结果，若置换检验后的结果较好，两条拟合线的斜率均⼤于0则可以尝试进⼀步分析。4 Q: 置换检验判断标准是什么?A: 通常标准是R2回归线的截距<0.4，Q2回归线的截距<0.05，但有的时候样本量太少，达不到。所以只要回归线斜率⼤于0，...
为了检验OPLS-DA有无过拟合,进行随机分组200次的置换检验。 VIP数值已导出,按照常规筛选差异物方法VIP>1 P<0.05,那还需要进行Students’t-test分析,获得P值,SIMCA也可以进行相应的分析,具体如下: 首先开启Omics skin功能(File-Options-Simca options-Skins-Enable Omics skin-Yes)。
Q: 数据导入SIMCA后看到三个组在PCA上区分不开,但是两两分析的时候OPLS-DA的Q2和R2都>0.5,还可以继续往下分析吗? A:OPLS-DA后的数据有没有价值进一步往下分析,可以根据置换检验的结果,若置换检验后的结果较好,两条拟合线的斜率均大于0则可以尝试进一步分析。
simca进行偏最小二乘法PLS-DA分析(omics插件置换检验) 3014播放 SIMCA软件下载以及应用与数据处理(PCA、HCA、OPLS-DA等) 7.9万播放 SPSS统计分析操作技巧:中心化和标准化(归一化) 1.3万播放 分子动力学模拟最后分析 2824播放 使用Excel进行数据归一化处理 7.5万播放 SPSS进行主成分分析 12.9万播放 热图—GraphpadPris...
为了检验OPLS-DA有无过拟合,进行随机分组200次的置换检验。 VIP数值已导出,按照常规筛选差异物方法VIP>1 P<0.05,那还需要进行Students’t-test分析,获得P值,SIMCA也可以进行相应的分析,具体如下: 首先开启Omics skin功能(File-Options-Simca options-Skins-Enable Omics skin-Yes)。