O2PLS-DA:双向正交偏最小二乘法 OPLS-DA:正交偏最小二乘法 PCA-Class:主成分分析(判别分类模型) PCA-X:主成分分析 PLS-DA:偏最小二乘法 确定模型后,点击确定 点击上方Home-Fit model-Add,添加要分析的主成分个数。 点击右边图像overview界面,即可得到想要的图形(得分图、载荷图、二维/三维的主成分分析图等...
SIMCA14软件的使用(HCA、PCA、OPLS-DA分析), 视频播放量 2416、弹幕量 0、点赞数 14、投硬币枚数 6、收藏人数 25、转发人数 4, 视频作者 在学习的小鱼丸, 作者简介 中药学研二|复方神经药理方向欢迎私信交流,相关视频:SIMCA14软件的使用(2),SIMCA14的使用(3),机器
本视频主要讲述关于GC-MS、电子鼻仪器的学术论文解读,并结合SIMCA如何做OPLS-DA分析(仅占视频的一小部分),以及讲述差异代谢物筛选、PCA、HCA、OAV、雷达图、指纹图谱等。,讲的不好的地方还请多多担待。, 视频播放量 59736、弹幕量 43、点赞数 1247、投硬币枚数 604、收
这里可以根据数据情况选择合适的Scaling方式。 OPLS-DA分析(以L5 VS WT为例) 为了检验OPLS-DA有无过拟合,进行随机分组200次的置换检验。 VIP数值已导出,按照常规筛选差异物方法VIP>1 P<0.05,那还需要进行Students’t-test分析,获得P值,SIMCA也可以进行相应的分析,具体如下: 首先开启Omics skin功能(File-Options-...
截图中Ctr或Par方式下是呈S型的,UV是做出来是直线 功能小贴士 在PCA或OPLS-DA得分图中右击选择Format plot即可对图中的细节进行修改,各个选项的功能如下: 1.Axis选项卡可对横纵坐标轴线条粗细和颜色、标尺字体大小、横纵坐标标题内容、字体和大小等进行修改; ...
之前小编出的教程还是SIMCA14.1的,时隔三年多了,SIMCA已经更新到SIMCA16版本了,很多老师买软件之后都询问有没有配套的教程,那么今天小编就告诉大家一个好消息,我们将陆续针对SIMCA16版本出相应的分析教程哦,其中包括常规的PCA\OPLS-DA\PCA-class\OPLS等,大家尽请期待吧。那么今天小编先给各位老师介绍SIMCA最常用的组学...
首先是PCA模型 这里我们选择Scaling方式为Ctr,Par和UV也是可以的: 1.Ctr是将原数据转化成离原点更近的新数据,Ctr=x-x拔; 2.UV是将所有变量拥有同等的重要性,UV=x-x拔/SD; 3.Par相比UV更接近原始测量数据,Par=x-x拔/根号SD; 这里可以根据数据情况选择合适的Scaling方式。
OPLS-DA分析中，我们通过置换检验检查过拟合，并利用VIP值和Student's t-test进行差异物筛选。Omics skin功能有助于获取P值和制作S-plot图，以便更精确地识别生物标志物。同时，我们分享了如何通过格式化plot选项自定义图表细节，包括坐标轴、网格线、背景、图例等元素。未来教程将涵盖SIMCA16的更多功能，...
在PCA或OPLS-DA得分图中右击选择Format plot即可对图中的细节进行修改,各个选项的功能如下: 1.Axis选项卡可对横纵坐标轴线条粗细和颜色、标尺字体大小、横纵坐标标题内容、字体和大小等进行修改; 2.Gridlines选项卡可对网格线有无、粗细、颜色等进行修改; ...
了解OPLS-DA的分析能力。只要可能,强烈建议将判别问题公式化为两类问题。这是因为所得的OPLS-DA模型只能有一个预测分量,这是最佳判别变量的最简单情况。 21、Hierarchical modeling for ‘zoom-in_zoom-out’ & multi-block data analytics 多元分析的分层方法极大地提高了我们洞察复杂数据分析问题的能力。