83.61%のリードが1回マッピングされた 4.49%のリードが2回以上マッピングされた→89.10%のマッピング率、まあこんなもんか、ちょっと低いか? *マッピング率が低いと他の生物種ゲノムのコンタミが疑われる、例えば微生物など。野外サンプルや表皮・腸管を含むサンプルでは注意すること2.6 ...
転写開始点じゃないところから転写が始まったり、逆に転写終了点を超えてリードスルーを起こしたり、スプライシングをミスったり、、、RNA-seq という技術は、そういう失敗作まで拾い上げてしまうから厄介なのだ。 下の図を例に取ると、2つのORFをまたいで4本のリードがマッピングされてい...