基因芯片与 RNA−Seq 是两种应用广泛的高通量 RNA 分析技术,关于他们的比较下列说法错误的是( )A.他们的通量均较高B.RNA−Seq
在探索性研究和非模式生物研究中,RNA-seq才是更合适的选择。 常见误区三: RNA-seq现在已经很便宜了,比基因芯片还便宜很多。 测序中收费标准之一来源于数据量(即测序深度),刚刚说了,市场上最流行的的RNA-seq服务数据量是6G/样本,即40M reads或者20M paired reads ,这时候确实比很多芯片都便宜了。但是如果希望更...
在～50M reads数据量的情况下,当基因表达丰度较高时(横坐标RPKM较大时),两者之间的数据质量都是非常好的(纵坐标CoV即变异系数越小,数据质量越高),但当基因表达丰度变低时(横坐标RPKM较小时),RNA-seq的数据质量就急剧下降了,而芯片则仍然维持着高水准。这篇文章得到的结论是:～80%以上的基因,RNA-seq的数据质...
在～50M reads数据量的情况下,当基因表达丰度较高时(横坐标RPKM较大时),两者之间的数据质量都是非常好的(纵坐标CoV即变异系数越小,数据质量越高),但当基因表达丰度变低时(横坐标RPKM较小时),RNA-seq的数据质量就急剧下降了,而芯片则仍然维持着高水准。这篇文章得到的结论是:～80%以上的基因,RNA-seq的数据质...
reads数据量的情况下,当基因表达丰度较高时(横坐标RPKM较大时),两者之间的数据质量都是非常好的(纵坐标CoV即变异系数越小,数据质量越高),但当基因表达丰度变低时(横坐标RPKM较小时),RNA-seq的数据质量就急剧下降了,而芯片则仍然维持着高水准。这篇文章得到的结论是:～80%以上的基因,RNA-seq的数据质量/可信度...