Degradome-RNA:该模块专门用于分析RNA的降解模式,主要是针对miRNA介导的降解片段进行测序,从而筛选和鉴定miRNA调控的靶基因。 RNA-RNA:该模块主要预测候选ncRNA及其靶标之间的RNA-RNA相互作用。 ceRNA-Network:本模块提供3个子模块,即mRNA-ceRNA、lncRNA-ceRNA和 pseudogene-ceRNA,用于可视化和分析竞争性内源RNA(ceRNA)...
该模块有6个子模块,包括RBP-mRNA、RBP-caRNA、RBP-lncRNA、RBP-pseudogene、RBP-sncRNA以及RBP-circRNA。RBP-Target和miRNA target类似,通过GEO数据库下载RNA结合蛋白RBP CLIP-seq测序结果,分析得到结合位点信息。 这里小编以“人A1CF”为例说明RBP-mRNA模块的用法。首先在页面左侧选项栏中设置条件。 条件全部设置好后...
RNA互作，靶基因预测，定位以及疾病分析数据库 RNA－互作、定位、疾病数据库 *RAID2.0中有这两个数据库的部分数据整合在其中，同时也在更新计划中，有需要可以关注。Refernce 1.RAIDv2.0：RNA-RNA、RNA-Protein互作模式，http://www.rna-society.org/raid/2.RNALocate：RNA的亚细胞定位数据库，http://www.rna...
RNA－互作、定位、疾病数据库 *RAID2.0中有这两个数据库的部分数据整合在其中，可以关注。RAIDv2.0RNA-RNA、RNA-Protein互作 http://www.rna-society.org/raid/ RAIDv2.0数据构成和打分系统 RAIDv2.0共包含mRNA、miRNA、lncRNA、circRNA、tRNA等10余种类型，超过527万条数据。可通过主页上的“Statistics”...
miRanda、TargetScan、RNAhybrid、psRNATarget、TAPIR是常见的第三方网页版小RNA工具,主要用于小RNA靶基因的预测分析,适用于大部分常见的科研物种。Diana工具集和ENCORI数据库则收录了丰富的RNA互作关系数据,帮助大家学习和深入挖掘noncoding RNA。 华大基因的技术支持工程师归佳栋老师,为大家带来《跟ncRNA有关的第三方数据...
需要金币:*** 金币(10金币=人民币1元) RNA互作,靶基因预测,定位以及疾病分析数据库培训资料.pdf 关闭预览 想预览更多内容,点击免费在线预览全文 免费在线预览全文 RNA互作,靶基因预测,定位以及疾病分析数据库培训资料 VIP免费下载 下载文档 收藏 分享赏 ...
本文标题:RNA互作,靶基因预测,定位以及疾病分析数据库-培训资料.ppt 链接地址:https://www.renrendoc.com/paper/96386801.html 网站客服侵权投诉 1:下载资料失败解决办法 2:不支持迅雷下载,请使用浏览器下载 3:不支持QQ浏览器下载,请用其他浏览器 4:下载后的文档和图纸-无水印 ...
①STRINGdb数据库导入 ②获取STRING_id ③PPI绘制 ④clustering分簇 ⑤富集分析 ⑥获取蛋白互作信息3.STRING 网页版的简单使用: 文件上传、各选项设置、数据导出 在得到我们感兴趣的基因集后,除了对其进行GO等富集分析查看与什么重要的生物学通路相关,还可以进行PPI蛋白互作网络(PPI, Protein-Protein Interaction Network...
Starbase是一个专注于RNA互作组的数据库,提供了miRNA靶标、RNA-RNA相互作用、ceRNA调控网络和RNA与蛋白结合信息等多种数据类型。 进入官网(http://starbase.sysu.edu.cn/),主页如下所示,最上方菜单栏中包含以下模块。 MiRNA-Target:该模块主要是预测与miRNA结合的靶基因,以及两者的结合位点。
Starbase是一个专注于RNA互作组的数据库,提供了miRNA靶标、RNA-RNA相互作用、ceRNA调控网络和RNA与蛋白结合信息等多种数据类型。 进入官网(http://starbase.sysu.edu.cn/),主页如下所示,最上方菜单栏中包含以下模块。 MiRNA-Target:该模块主要是预测与miRNA结合的靶基因,以及两者的结合位点。