在 ANNOVAR 注释之后,给出的几个结果字段(pLi.refGene、AF_gnomAD_2.1.1、REVEL_score、MPC_score、CADD_phred)各自有不同的含义: pLi.refGene (pLI score): pLI(probability of being loss-of-function intolerant)分数是用来预测一个基因是否对功能丧失(loss-of-function, LoF)变异敏感的指标。高pLI分数(接近...
关于ANNOVAR RefGene的说明 小一_Sherry关注IP属地: 陕西 2018.10.29 17:02:39字数0阅读435©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者 0人点赞 日记本 更多精彩内容,就在简书APP "小礼物走一走,来简书关注我"赞赏支持还没有人赞赏,支持一下 小一_Sherry医学院学生物信息 总资产1共写了1276字获得28个...
骚年~不要急,没annovar怎么注释的refGene吗?你似不似傻?哈哈哈~ 采用annovar软件的refGene的运行参数是refGeneWithVer,按照gene过滤(-operation -g)。这时调用的refGene数据库就是如下格式的: 图1. refGene数据库截图 哈哈,这下你看不懂了吧!因为没有表头~而如果想知道annovar是怎么注释的必须知道每例的意思。
ANNOVAR 是一种常用的基因组注释工具,它可以提供关于基因变异的详细信息。在 ANNOVAR 注释之后,给出的几个结果字段(pLi.refGene、AF_gnomAD_2.1.1、REVEL_score、MPC_score、CADD_phred)各自有不同的含义: pLi.refGene (pLI score): pLI(probability of being loss-of-function intolerant)分数是用来预测一个基因...