R pairwise.t.test 成对 t 检验R语言 pairwise.t.test 位于stats 包(package)。 说明 通过多次测试的校正计算组水平之间的成对比较 用法 pairwise.t.test(x, g, p.adjust.method = p.adjust.methods, pool.sd = !paired, paired = FALSE, alternative = c("two.sided", "less", "greater"), ....
pairwise.t.test(x, g, p.adjust.method = p.adjust.methods, pool.sd = !paired, paired = FALSE, alternative = c("two.sided", "less", "greater"), ...) 我们使用R自带的airquality数据进行展示,比较不同月份的航班数之间是否有区别 pairwise.t.test(airquality$Ozone, airquality$Month, p.adj ...
直接用t检验两两比较会增加Ⅰ类错误概率,所以需要校正。可以使用Bonferroni 法、Tukey的HSD检验法等校正。参考:R语言与医学生:R语言统计—多重比较(1) 4.1 TukeyHSD TukeyHSD(fit) TukeyHSD 4.2 pairwise.t.test pairwise.t.test(data$gene39, data$Stage) pairwise.t.test (bolm) 默认bolm法校正p值 改用...
函数pairwise.t.test()能够计算所有的两组比较。他能够针对多重检验做调整: > pairwise.t.test(folate,ventilation,p.adj="bonferroni") Pairwise comparisons using t tests with pooled SD data: folate and ventilation N2O+O2,24h N2O+O2,op N2O+O2,op 0.042 - O2,24h 0.464 1.000 P value adjustment ...
1. t检验(pairwise.t.test):当数据满足正态性和方差齐性假设时,可以使用t检验来进行两两比较。该函数会对每对组进行t检验,计算出每对之间的差异显著性水平和置信区间。 ```R pairwise.t.test(data$group, data$value, p.adjust.method = "bonferroni") ``` 2. 方差分析(ANOVA):如果数据不满足t检验的...
R语言正则表达式速查表 r语言pairwise.t.test Peak Calling 关于MACS2的使用方法, 我写了如何使用MACS进行peak calling详细地介绍了它的参数,在用MACS2之前尽量去阅读下。 尽管文章说他按照默认参数分别找narrow peak 和 broad peak, 即"We used MACS2 with default settings to call narrow (or broad when ...
variability被称作变异性或者可变性，它描述了数据点彼此之间以及距分布中心的距离。
>scheffe.test(aov(folate ~ ventilation),‘ventilation’) #这是agricolae包的scheffe.test函数 以上是最常见的几种方法。 1. 2. 3. 4. 这里还有一种方法叫成对比较,pairwise.t.test,非常好用,,能显示成对比较的p值表。 代码示例 >pairwise.t.test(folate,ventilation,p.adjust.method = ‘bonferroni’...
在R中,使用pairwise.t.test()函数可以帮助我们完成多重T检验,该函数的原型如下: pairwise.t.test(x, g, p.adjust.method = p.adjust.methods, pool.sd = !paired, paired = FALSE, alternative = c("two.sided", "less", "greater"), ...) ...
pairwise.t.test(x,g,p.adjust.method="holm")——多重t检验,p.adjust.method是P值的调整方法,其方法由p.adjust()给出,默认值按Holm方法(”holm“)调整,若为”none“,表示P值不做任何调整。双因素交互作用时g=A:B shapiro.test(x)——数据的正态W检验 ...