SVM-RFE在临床研究中的详细应用 SVM-RFE在临床研究中的应用广泛而深入,以下是几个具体的应用场景: 1.癌症生物标志物的发现:通过分析肿瘤组织和正常组织的基因表达数据,SVM-RFE可以帮助研究者识别出区分肿瘤和正常组织的分子标记物,为癌症的早期诊断和治疗提供依据。 2.药物反应性预测:在药物研发过程中,SVM-RFE可以...
换r的版本，看它报错对应什么版本，你安装那个版本的r就是了
【1】lncRNA的拷贝数变异下游相关分析【2】R可视化:ggstatsplot包—科研界的美图秀秀【3】随机森林算法用于分类预测和筛选诊断标志物【4】基于本地Java版GSEA的输出结果整合多个通路到一张图【5】基于岭回归模型和基因表达矩阵估算样本对药物反应的敏感性【6】基于R包NMF对样本进行分型分析【7】DALEX包用于探索、解...
简介: caret包全称是(Classificationand Regression Training),应用之一就是数据预处理,比如我们常用的拆分训练集和验证集。 caret包应用之二: 特征选择,比如我们的svm-rfe这种特征选择就是可以帮助我们在svm的基础上进行选择最重要的特征,弥补e1071包的不租,caret包还可以参与建模与参数优化和模型预测与检验,里面功能很...
caret包应用之二:特征选择,比如我们的svm-rfe这种特征选择就是可以帮助我们在svm的基础上进行选择最重要的特征,弥补e1071包的不足,caret包还可以参与建模与参数优化和模型预测与检验,里面功能很强大。 缺点:可能需要做点和内部函数相关的可视化功能。 8. kmeans聚类...
rfeControl 控制选项列表,包括拟合预测的函数。一些模型的预定义函数如下:linear regression (in the object lmFuncs), random forests (rfFuncs), naive Bayes (nbFuncs), bagged trees (treebagFuncs) and functions that can be used with caret...
包裹法:包裹法是一种基于模型训练的特征选择方法。R语言中的stepAIC()函数可以进行逐步回归,从而选择最佳的特征组合。rfe()函数可以进行递归特征消除,从而选择出最优的特征子集。 嵌入法:嵌入法是一种将特征选择嵌入到模型训练过程中的方法。R语言中的lasso()和ridge()函数可以进行L1和L2正则化,从而选择出最优的特...
# rfe函数中有3种变量筛选方法:svmLinner; svmPoly; svmRadial # size指定自变量个数 # 指定自变量和因变量 X <- data[,2:60] Y <- data[,1] svm.feature <- rfe(X,Y,sizes = 30:1, rfeControl = selecMeth, method = 'svmPoly')
caret包应用之二:特征选择,比如我们的svm-rfe这种特征选择就是可以帮助我们在svm的基础上进行选择最重要的特征,弥补e1071包的不租,caret包还可以参与建模与参数优化和模型预测与检验,里面功能很强大。 8. kmeans聚类 简介:k(均值)聚类属于扁平聚类算法,即进行一层划分得到k个簇,与层次聚类算法开始不需要决定簇数...
表征模型之间的差异(使用产生的train,sbf或rfe通过它们的重新采样分布)。 首先,支持向量机模型拟合声纳数据。使用preProc参数对数据进行标准化 。请注意,相同的随机数种子设置在与用于提升树模型的种子相同的模型之前。 代码语言:javascript 复制 set.sed(25)Ft<-tran(preProc=c("center","scale"),metric="ROC")...