library(ggplot2) #我们先来看看ggplot2默认的主题设置函数theme_gray()的源代码 theme_gray#函数名不加括号可获得函数源代码 ## function (base_size = 11, base_family = "") ## { ## half_line <- base_size/2 ## theme(line = element_line(colour = "black", size = 0.5, linetype = 1, ...
本期来介绍ggplot2包绘制火山图的方法,火山图通常用于生物学、医学、环境科学等领域,以展示基因表达、蛋白质含量、化学成分等在不同实验条件下的变化情况,适用于两组样本直接的比较。本期教学使用的数据由Deseq2包差异分析得到:【文末关键词“火山图”获得本期代码和数据】。 载入R包和数据 rm(list=ls()) pacm...
ggplot(diamonds2, aes(x = price)) + geom_freqpoly() #频次表,显示不同价格出现的次数 ggplot(diamonds2, aes(x = cut, y = price)) + geom_violin() #小提琴图 ggplot(diamonds2, aes(x = cut, y = price)) + geom_boxplot() #箱形图 ggplot(diamonds2, aes(x = cut, y = price,colo...
theme() 的语法有自己的一套风格,我感觉和ggplot2总体的风格类似,个人理解:它是针对图像的不同层次命名函数,并进行修改,并且后边的设置可以覆盖前面的设置,例子应该更能形象生动的展现。 在上一篇ggplot2-概述学习的结尾,也有讲到一部分theme的理解~: 【R语言-ggplot2学习-概览】 接下来跟着官方帮助文档学一些基本...
在这段代码中,我们使用ggplot函数创建了一个基本的绘图对象,并使用geom_tile函数绘制了热图。通过geom_text函数,我们还添加了对应的p值显著性标记。这张热图将展示环境因子和物种之间的相关性,并通过颜色填充来表示p值的显著性。 接下来,我们定义一个函数cal,用于计算不同组内物种与环境因子之间的相关性。代码如下:...
001、基础绘图 library(ggplot2)#导入ggplot包 ggplot(data = mtcars, aes(x = wt, y = mpg, colour = factor(cyl))) + geom_point() + theme_bw() 002、设置刻度标签的粗细 librar
ggplot(df,aes(x=factor(rownames(df),levels=rownames(df)),y=value,fill=group,color=group))+geom_point(pch=21)+geom_line(group=group)+labs(x="",y="value") 常用背景1:theme_bw ggplot(df,aes(x=factor(rownames(df),levels=rownames(df)),y=value,fill=group,color=group))+geom_point(...
ggplot(df, aes(x = x, y = y)) + geom_point() + theme_bw()自定义主题 除了使用内置主题，用户还可以通过`theme()`函数自定义图表的主题。这使得用户能够根据自己的需求和偏好，创建完全个性化的图表外观。示例代码 下面是一个简单的例子，展示如何使用`theme()`来创建自定义主题：r 创建自...
ggplot(data=mtcars,aes(x=wt,y=mpg)) geom_point() 通过' ' 在基础图层上添加上散点(geom_point()) ,得到一幅简单的散点图,后面还能添加更多的图层得到复杂的图形 映射 映射即视觉通道映射,通俗来说就是将数据映射到图形的某一成分中,数据会以指定的形式在图形中得以呈现 使用到函数aes(),除了最基础的...
ggplot2作图X轴默认坐标轴的刻度是朝下的,Y轴默认的刻度是朝左的,如果要改为朝上和朝右,该如何设置。之前也有人问过这个问题 代码语言:javascript 复制 library(ggplot2)library(ggstar)ggplot()+geom_star(aes(x=1,y=1),size=100,starshape=16,fill="red")+theme_bw()+theme(axis.ticks.length.x=uni...