ggplot2中主要是用到了geom_boxplot()函数,同时包含添加箱须的stat_boxplot()函数,具体以mtcars数据作为案例进行绘制。 ▉首先来一个简单的箱型图 library(ggplot2) mtcars$cyl.f <- factor(mtcars$cyl,levels=c(4,6,8), labels=c("4","6","8")) mtcars$am.f <- factor(mtcars$am,levels=c(0,...
exprSet2$GAPDH <- scale(exprSet2$GAPDH) 主要包括三个图层,我们按照顺序逐步添加小提琴图、样本散点图与boxplot。每一层都需要注意设置宽度与颜色映射;调整颜色透明度防止过度遮盖。 p <- ggplot(exprSet2, aes(x = PAM50, y = GAPDH)) + #violinplot本体 geom_violin(aes(fill = PAM50),color = NA...
geom_boxplot(outlier.colour="red", outlier.shape=8, outlier.size=4) 2.3 带点箱线图 代码语言:text 复制 #初始箱线图 p <- ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_boxplot() #显示每个值 p + geom_dotplot(binaxis='y', stackdir='center', dotsize=1) 代码语言:text 复制 #发...
在R语言中绘制箱线图(Box plot)是一个常见的操作,它可以帮助我们直观地了解数据的分布情况。以下是关于如何在R语言中绘制箱线图的详细步骤: 准备数据: 在绘制箱线图之前,首先需要准备好要展示的数据。数据可以是向量、矩阵或数据框等形式。例如,我们可以使用R语言内置的数据集,或者自己创建一个数据集。 R # 使...
三、箱线图boxplot 箱线图(Box plot)也称箱须图(Box-whisker Plot)、箱线图、盒图,可以用来反映一组或多组连续型定量数据分布的中心位置和散布范围,因形状如箱子而得名。1977年,美国著名数学家John W. Tukey首先在他的著作《Exploratory Data Analysis》中介绍了箱形图。箱线图(又称盒须图)通过绘制连续型变...
boxplot 用于绘制箱线图,我们都知道boxplot 用于展示一组数据的总体分布,在R语言中,支持两种输入数据的方式 第一种:x , 这个参数指定用于绘制箱线图所用的数据,是一个向量 代码示例: boxplot(1:100) 效果图如下: 第二种, 通多formala 和 data 两个参数指定,适合展示多组数据的分布 ...
boxplot 用于绘制箱线图,我们都知道boxplot 用于展示一组数据的总体分布,在R语言中,支持两种输入数据的方式 第一种:x , 这个参数指定用于绘制箱线图所用的数据,是一个向量 代码示例: boxplot(1:100) 效果图如下: 第二种, 通多formala 和 data 两个参数指定,适合展示多组数据的分布 ...
在R中,boxplot()函数可以完成箱线图的绘制。下面,为大家带来简单箱线图、分组箱线图以及交叉因子箱线图的绘制 简单箱线图 使用格式为:boxplot(formula, data=dataframe),其中的formula是一个公式,dataframe代表提供数据的数据框(或列表)。 一个示例公式为y ~ A,这将为类别...
#绘制boxplot p=ggboxplot(data, x="Gene", y="Expression", color = "Type", ylab="Gene expression", xlab="", legend.title=x, palette = c("blue","red"), width=0.6, add = "none") p=p+rotate_x_text(60) p1=p+stat_compare_means(aes(group=Type), method="wilcox.test", symnum...
p=ggboxplot(rt, x="Type", y="expression", color = "Type", palette = col, ylab=y, xlab=x, #add = "jitter", #绘制每个样品的散点 legend = "right") pdf(file=outFile, width=10, height=6) #输出图片文件 p+rotate_x_text(60) #倾斜角度 dev.off()©...