今天,小编就用R语言中的两个包——mixOmics包和ropls包,再结合ggplot2包给大家讲解一下PLS-DA的计算及可视化过程。 基于mixOmics包实现的PLS-DA计算 1、加载包 rm(list=ls())#clearGlobalEnvironmentsetwd('D:\\桌面\\PLSDA分析')#设置工作路径#加载包library(mixOmics)#用于偏最小二乘判别分析的包library(ggpl...
偏最小二乘法判别分析,即我常说的PLS-DA(Partial Least Squares Discriminant Analysis),经常被用来处理分类和判别问题。这种方法和PCA分析方法是比较类似的,区别在于二者是否有监督,一般PCA是无监督的,而PLS-DA是有监督的。 当碰到样本组间差异大而组内差异小的情况,常见的PCA分析方...