Q-Q plot全称是quantile-quantile plot,也就是分位图,基本原理是通过比较两个概率分布的分位数,从而实现对两个概率分布进行比较。 1.3 Q-Q plot怎么解读? ✅STEP1Q-Q plot的Y轴是SNP位点的p值(实际结果,即observed);X轴是则是均匀分布的概率值(期望值,即Expected); Note! 上述指标均为
二、QQ-PLOT 两个quantile。quantile是我们的数据和标准正态分布的很多分位数组成的数组画出来的图。横坐标是标准的正态分布的quantile 纵坐标是我们数据的图。如果两者基本相等,则这个散点图会非常像y=x 三、shapiro假设检验 Installation failed with message INSTALL_FAILED_NO_MATCHING_ABIS: Failed to extract ...
qplot,是quick plot的简称。大部分人熟悉了plot,如果直接上手ggplot可能很多同学难受、不习惯,所以hadley Wickham给了一个类似plot的ggplot,可以当作一个定制版的ggplot。 ?qplot 在help中就看到qplot的用法和参数说明,如下: `Usage: qplot(x, y = NULL, ..., data, facets = NULL, margins = FALSE, geom =...
pvclust, agnes, diana 基于模型的方法: mclust 基于密度的方法: dbscan 基于画图的方法: plotclust...
1.2 Q-Q plot的原理是什么? Q-Q plot全称是quantile-quantile plot,也就是分位图,基本原理是通过比较两个概率分布的分位数,从而实现对两个概率分布进行比较。 1.3 Q-Q plot怎么解读? ✅STEP1Q-Q plot的Y轴是SNP位点的p值(实际结果,即observed);X轴是则是均匀分布的概率值(期望值,即Expected); Note!