python ovito模块计算MSD的基本原理:添加管道修饰命令CalculateDisplacementsModifier,计算出每一帧原子的位移,把原子位移带入计算公式,得到该帧对应的MSD值。 最后,把每一帧的MSD输出到文本文件。 程序使用方法:复制一下代码,保存为msd.py文件,和dump.xyz保存到一个文件夹中,使用命令行进入该文件夹,输入命令: python...
随着数据的积累,数据的维度越来越高,高维的数据在带来更多信息的同时,也带来了信息冗余、计算困难等问题,所以对数据进行合理的降维,并保留主要信息非常重要。这些问题主要可以通过主成分分析及相关的降维算法来解决。 一些经典的降维算法有:主成分分析、MSD降维、t-SNE降维等。 1: 数据准备 将会使用手写体数字数据,该...
1.对于一个常数 ,计算: 这里 。我们可以画出分别以 和 为横轴和纵轴的轨迹图,其图形产生的布朗运动可以表征混沌现象。 2.为了分析 和 的扩散行为,我们可以计算位移均方差MSD,计算式为: 这里,一般 ,但是这里的 如果采用原始序列的长度,那么横线处的 将超出本身大小,所以我认为 ,这块我查阅了一些参考文献,都没...
SAD(Sum of Absolute Difference)=SAE(Sum of Absolute Error)即绝对误差和 SSD(Sum of Squared Difference)=SSE(Sum of Squared Error)即差值的平方和 SATD(Sum of Absolute Transformed Difference)即hadamard变换后再绝对值求和 MAD(Mean Absolute Difference)=MAE(Mean Absolute Error)即平均绝对差值 MSD(Mean Sq...
排序方式:LSD 由右向左排; MSD 由左向右排 稳定性:稳定 基数:在数学上,基数或势,即集合中包含的元素的“个数” 基数:计算的基数就是基本的单元数。比如10进制的基数就是10,二进制的基数就2,八进制的基数是8等等 基数排序:一位一位的对比排序(msd) ...
最高位优先(Most Significant Digit first)法,简称MSD 法: 1)先按k1 排序分组,将序列分成若干子序列,同一组序列的记录中,关键码k1 相等。 2)再对各组按k2 排序分成子组,之后,对后面的关键码继续这样的排序分组,直到按最次位关键码kd 对各子组排序后。
性质计算: ✅金属、聚合物、及其复合材料的拉伸、压缩模拟; ✅纳米压痕、冲击计算;热传导计算; ✅聚合物的交联反应; ✅超算批量提交LAMMPS计算任务。 结果分析: ✅径向分布函数(RDF)、概率分布函数(PDF)、 ✅扩散系数、均方位移(MSD); ✅位错分析、表面张力、氢键寿命; ...
最高位优先(Most Significant Digit first)法,简称MSD法。...整数排序时,每一位的范围都在0~9之间,所以需要创建10个桶。 3. 从数据的个位开始(从最高位开始也可以,结果一样),按个位数对数据进行分桶,不考虑其它位的数据大小。 4...时间复杂度 在基数排序中,需要走访待排序列表中的每一个元素进行分...
max_val 是数组中的最大值,用于计算位数。 计算最大值的位数。 创建10 个桶用于分配数据。 将元素分配到对应的桶中,根据位数的不同。 合并所有的桶,得到有序数组。 示例代码 下面是一个使用Python进行基数排序的示例代码: 代码语言:javascript 代码运行次数:0 ...