研究人员首先通过研究人员利用抗坏血酸过氧化物酶(ascorbate peroxidase,APEX2)邻近标记技术,结合质谱分析,发现TTP的互作组高度依赖于其与RNA的结合能力。TTP的野生型(WT)与RNA结合缺陷型(TZFmut)的互作组存在显著差异,脱腺苷复合物组分...
富含精氨酸和丝氨酸的SR蛋白就是一种典型的反式作用因子,它通过招募U1 snRNP(即由核小RNA U1与蛋白质结合而成的核小核糖核蛋白)到RNA识别基序的5'端,或者招募U2 snRNP辅助因子(U2AF)到RNA识别基序的分支点序列(BPS),启动形成新生的剪...
miniGene是在体外构建含有突变位点的部分外显子及内含子载体,转染细胞,运用RT-PCR及测序技术,分析基因变异对pre-mRNA序列的影响,适用于无突变细胞系,但突变点可能改变mRNA序列的情况。 突变之所以影响pre-mRNA剪切,是因为基因在内含子和外显子中均包含各种顺式作用元件,这是前体信使RNA(pre-mRNA)正确、有效的拼接所...
且 CPSF3 可通过剪切 PAS 序列,促进线性 mRNA 生成,抑制 circRNA 生成 (图5C)。 图5. (A) 双荧光报告系统原理图;(B) 线性及环状 RNA 在不同质粒中的表达;(C) Red-PAS-cGFP 质粒在 CPSF3 敲除及过表达细胞中的表达。 6. CPSF3 抑制 circRNA 生成并破坏 miRNA 介导的基因沉默 RNA 测序分析发现 CPS...
1)在RNA-RNA相互作用层面上,通过改变snRNA与pre-mRNA的相互作用来影响外显子剪接; 2)在RNA-蛋白相互作用层面上,通过增强剪接因子与其在pre-mRNA结合位点之间的相互作用来改变剪接产物; 3)在pre-mRNA二级结构层面上,通过阻断或暴露剪接因子结合位点的二级结构或剪接位点序列对snRNA结合部位的二级结构来实现调控(图3A,...
上述结果充分地解释了为什么大部分的内含子序列与TSEN没有直接的相互作用,而不同内含子的pre-tRNA可以被容纳和裂解,解析了人类TSEN去除pre-tRNA内含子的分子机制。 值得一提的是,施一公及张晓峰团队于两个月前发表的研究论文:Mechanisms of the RNA helicases DDX42 and DDX46 in human U2 snRNP assembly,揭秘三种...
可变剪接与非编码RNA 科学家们将通过pre-mRNA的位点选择性剪接实现外显子选择性重组的过程称为选择性剪接(即可变剪接,AS),由剪接体(主要成分为富含U的小核RNA(snRNA)和小核核糖核蛋白颗粒(snRNP))调节,其中U1、U2、U4、U5和U6是代表性的snRNP(Choi et al., 2023)。而外显子和内含子是根据顺式调节序列和反...
✂️ 内含子被移除,外显子(编码序列)被连结起来,在成熟mRNA中形成连续的编码序列。 🔀 可发生可变剪接,不同的外显子以各种组合连接,使单个基因能产生多种蛋白质。2️⃣ 5'端加帽(Capping): 🛡️ 当pre-mRNA刚从RNA Polymerase II出现时,5'端就被加上了一个5'帽。
SR蛋白可通过其识别 RNA的基序(RNArecognition motif, RRM)结构域与RNA 结合,又通过 RS 结构域招募剪接装置到剪接位点,从而选择了剪接的外显子序列。剪接抑制蛋白有RRM 结构域,但缺失 RS结构域,它与RNA结合不能够招募剪接装置,由此阻塞了附近剪接点的作用。SR蛋白质家族很大,而且多种多样,它们决定着在发育的特殊...
1)在RNA-RNA相互作用层面上,通过改变snRNA与pre-mRNA的相互作用来影响外显子剪接; 2)在RNA-蛋白相互作用层面上,通过增强剪接因子与其在pre-mRNA结合位点之间的相互作用来改变剪接产物; 3)在pre-mRNA二级结构层面上,通过阻断或暴露剪接因子结合位点的二级结构或剪接位点序列对snRNA结合部位的二级结构来实现调控(图3A,...