直接分析已知蛋白之间的相互作用,并能寻找、分离与已知蛋白相互作用的配体,在研究抗原和抗体相互作用、发...
蛋白质互作网络(PPI, Protein-Protein Interaction Networks)是由蛋白通过彼此之间的相互作用构成,来参与生物信号传递、基因表达调节、能量和物质代谢及细胞周期调控等生命过程的各个环节。系统分析大量蛋白在生物系统中的相互作用关系,对了解生物系统中蛋白质的工作原理,了解疾病等特殊生理...
蛋白质相互作用(PPI)可以说是人体最重要的分子事件之一,事关人体生长发育、新陈代谢,是疾病治疗干预的重要来源,PPI失调会导致癌症等疾病发生,因而该领域也是医药行业关注的研究热点。 为了更好地预测和解读PPI,并深入挖掘相关分子信息,2023年3月,腾讯 AI Lab 联合香港科技大学、中国科学院大学相关团队,将深度学习领域...
PPI是指两种或以上的蛋白质结合的过程,通常旨在执行其生化功能。在细胞中,大量蛋白质元件组成分子机器,...
本文以蛋白质-蛋白质相互作用数据为例,展示了如何使用微生信云平台在线绘制带community的分子相互作用网络图。 1,打开作图URL https://www.bioinformatics.com.cn/basic_protein_protein_interaction_network_by_igraph_256 2,示例数据 点击图片上方的示例数据,下载,并使用excel打开。
PPI(Protein-Protein Interaction,蛋白质相互作用)探针是用于研究蛋白质之间相互作用的工具或技术。蛋白质相互作用在生物学中非常重要,因为它们决定了细胞内的信号传导、代谢途径、细胞周期调控等生命活动。PPI探针的作用是为了理解这些相互作用的本质,以及它们如何影响细胞功能和生物学过程。
蛋白质与蛋白质相互作用(Protein-Protein Interaction, PPI)研究方法概述目前检验蛋白质之间相互作用的实验方法主要有:酵母双杂交系统(Yeast two-hybrid system)、噬菌体展示技术(Phage display)、串联亲和纯化-质谱(Tandem affinity purification-mass spectrometry, TAP-MS)以及GST pull-down。其原理与适用范围如下...
PPI网络是指由蛋白质组成的网络结构,其中的节点表示蛋白质,边表示蛋白质之间的相互作用。PPI预测技术的原理就是利用已知的PPI网络为基础,基于蛋白质结构、氨基酸序列等信息,进行蛋白质相互作用的预测。具体来说,预测技术可以分为基于图论、机器学习、深度学习等不同的分类。 二、PPI预测的方法 1.基于图论的方法 基于...
上述的网络我们就称之为蛋白质相互作用网络,protein-protein interaction network, 即PPI网络。要看懂上面这张图,需要理解以下两个方面 1. 节点(node) 图中每个节点表示一个蛋白,由于真核生物的可变剪切和转录后修饰,1个蛋白编码基因可能会产生多个蛋白,这里将由同一个基因产生的不同isoform进行了合并,在节点上标记...