R语言用LOESS(局部加权回归)季节趋势分解(STL)进行时间序列异常检测 PYTHON用时变马尔可夫区制转换(MRS)自回归模型分析经济时间序列 R语言随机森林RandomForest、逻辑回归Logisitc预测心脏病数据和可视化分析 基于R语言实现LASSO回归分析 Python用PyMC3实现贝叶斯线性回归模型 使用R语言进行多项式回归、非线性回归模型曲线拟合 ...
进行PLS-DA分析 📈 现在,我们可以开始PLS-DA分析啦!运行以下代码:```R df_plsda <- plsda(otu, group$group, ncomp = 2) # ncomp表示要提取的主成分数量,这里我们设置为2。你可以根据需要调整这个值。 ``` 绘制散点图 🎨 接下来,我们用PLS-DA的结果绘制散点图。运行以下代码:```R plotIndiv(df...
R语言用LOESS(局部加权回归)季节趋势分解(STL)进行时间序列异常检测 PYTHON用时变马尔可夫区制转换(MRS)自回归模型分析经济时间序列 R语言随机森林RandomForest、逻辑回归Logisitc预测心脏病数据和可视化分析 基于R语言实现LASSO回归分析 Python用PyMC3实现贝叶斯线性回归模型 使用R语言进行多项式回归、非线性回归模型曲线拟合 ...
3、PLS-DA计算及展示 #由于排序分析函数所需数据格式原因,需要对数据进行转置otu<-t(otu_raw)#计算PLS-DAdf_plsda<-plsda(otu,group$group,ncomp=2)#简单绘图plotIndiv(df_plsda,comp=c(1,2),group=group$group,style='ggplot2',ellipse=T,size.xlabel=20,size.ylabel=20,size.axis=20,pch=16,cex=...
判别分析,即我们常说的PLS-DA(Partial Least Squares Discriminant Analysis),经常被用来处理分类和判别问题。这种方法和PCA分析方法是比较类似的,区别在于二者是否有监督,一般PCA是无监督的,而PLS-DA是有监督的。 当碰到样本组间差异大而组内差异小的情况,常见的PCA分析方法是可以很好地区分组间差异的,但是遇到样本...
从海量数据中发现潜在标志指标, 需要借助多变量模式识别方法. 无监督的模式识别方法包括主成分分析(PCA、聚类分析(HCE)等,根据模式识别模型抽提出对分类有重要贡献的指标后, 如果还需要进一步验证这些指标的差异性,那么可以在r语言中使用PLSDA模型进行分析。
本视频主要介绍偏最小二乘判别分析(PLS-DA)如何基于r语言实现。讲解了绘图问题,模型失败问题。代码均在不懂绘图公众号,需要自取。, 视频播放量 444、弹幕量 0、点赞数 17、投硬币枚数 8、收藏人数 37、转发人数 0, 视频作者 请叫我前辈先生, 作者简介 在物是人非的世界
PLS-DA (Partial Least Squares Discriminant Analysis) 是一种多变量统计分析方法,常用于处理具有多个预测变量和多个响应变量的数据。在本文中,我们帮助客户使用了PLS-DA方法来挖掘两个疾病的不同中医分组方式下存在差异的指标。 首先,我们有两个Excel文件,分别是患者的证素数据。每一列代表一位患者的多个数据,不同颜...
R语言PLS-DA模型分析不同中医组别患者间差异指标数据可视化,PLS-DA(PartialLeastSquaresDiscriminantAnalysis)是一种多变量统计分析方法,常用于处理具有多个预测变量和多个响应变量的数据。在本文中,我们帮助客户使用了PLS-DA方法来挖掘两个疾病的不同中医分组方式下存在
从海量数据中发现潜在标志指标, 需要借助多变量模式识别方法. 无监督的模式识别方法包括主成分分析(PCA、聚类分析(HCE)等,根据模式识别模型抽提出对分类有重要贡献的指标后, 如果还需要进一步验证这些指标的差异性,那么可以在r语言中使用PLSDA模型进行分析。