PREFIX=/home/<USER>/anaconda3 # /home/<USER>/anaconda3就是你想要安装的路径 如果你像按照系统默认,就是它显示的这个:/public/home/Pwjb/anaconda3 那你就直接按一个回车就行 最后安装结束时,他还会弹出一段文字,问你输入yes还是no yes就是按照它默认添加环境变量 如果你选择no,那就是需要自己写一下环境...
Phonopy安装教程 基于Ubuntu18.04系统和python3.6环境 软件下载地址 Github地址:github.com/atztogo/phon PyPI地址:pypi.org/project/phonop SOURCEFORGE地址(主要是老版本1.11以前):sourceforge.net/project 安装编译 1 pip安装 pip install phonopy==2.4.2 #==后面跟具体的版本号 2 源码安装 tar -zxvf phonopy....
一步到位安装(如果有Anaconda)对于拥有Anaconda环境的朋友,安装只需三步:下载官网提供的安装包,将其拖到shell中,然后按照提示进行操作。输入命令后,会依次出现几个界面,只需根据提示进行确认和回车,最后出现安装成功提示。细致安装步骤(无Anaconda)如果没有Anaconda,你需要从下载安装包开始,然后按照...
用vasp 计算得到的 vasprun.xml 生成力常数文件 FORCE_CONSTANTS。 phonopy --fc vasprun.xml 5. phonopy 后处理 需要准备输入文件 # band.confATOM_NAME=NaClDIM=222PRIMITIVE_AXIS=0.00.50.50.50.0
Ubuntu Phonopy安装 简介 Phonopy 是一个由 python编译实现的的晶体声子分析程序,是一款一款进行基于第一性原理的声子计算软件的免费软件。它是目前提供了 VASP 的 Wien2k 的接口用来计算原子受力。它的主要功能有:计算声子色散谱; 计算声子态密度,包括分立态密度; 晶体热力学性质,包括自由能,热容量,熵。(注...
在以往推送内容中也有介绍基于phonopy的众多使用说明,包括:VASP+phonopy计算声子群速与数据导出phonopy计算模式格林艾森常数通过phonopy产生特定温度随机位移phonopy计算声子谱单位转换计算案例:共线反铁磁FeGe声子色散计算Phonopy-Spectroscopy计算材料红外和Raman光谱等等等等 phonopy的安装相对来说非常简单,可通过pip快速安装的...
第三步:安装numpy-1.11.2.tar.gz tar xzvf numpy-1.11.2.tar.gz cd numpy-1.11.2 cp site...
本文介绍VASP结合Phonopy计算声子谱和声子态密度的过程,包括相关软件安装、计算流程及示例。首先,声子谱的计算主要有两种方法:有限位移法和微扰密度泛函方法(DFPT)。有限位移法在优化后的平衡结构中引入原子位移,计算作用在原子上的力,进而得到声子色散曲线。然而,该方法在复杂系统中使用受限,尤其是对于...
phonopy安装: 第一步:准备文件## python-3.6 (https://www.python.org/downloads/source/) numpy-1.11.2 (Obtaining NumPy & SciPy libraries) lxml-3.6.4 (Processing XML and HTML with Python) matplotlib-1.5.0 (Browse Files at SourceForge.net) ...
它利用VASP等第一性原理计算程序来计算有限位移下的原子受力,然后利用phonopy程序处理原子受力获得声子谱。Phonopy使用python的matplotlib等工具包来绘图,因此在使用Phonopy绘制声子谱等图形时,要求系统有图形用户界面,对于远程机器,需要安装x-manager来获得虚拟的图形用户界面,方法如下:在自己的pc机安装windows版本的X...