计算结束后:首先使用phonop -f vasprun.xml-0*得到Force_sets文件。如果要得到Force constants,接着执行如下操作: 建立mesh.conf文件,内容为: 然后执行命令phonopy -p mesh.conf,可以从Force_sets得到Force constants文件。 建立band.conf文件,内容为: 执行phonop -p --factor=521.471 band.conf和phonopy-bandplot...
⑧准备好上述文件以后,连续执行以下三条命令: phonopy -f vasprun.xml-* phonopy --dim='5 5 1' -c POSCAR-unitcell band.conf phonopy-bandplot --gnuplot>551.dat 就可以获得二阶力常数矩阵 FORCE_CONSTANTS 和声子谱的数据 551.dat. 最后,声子谱的数据 551.dat 可以拖进 OriginLab 绘图软件中绘制声子...
TOLERANCE = 1E-3 这样使用了命令phonopy -p raman.conf 后出现这样的提示：__ __ | |__ __...
(4) 为了绘图方便,接着输入如下命令,将thermal_properties.yaml文件转换成thermal.dat文件; (5) 用Notepad++打开thermal.dat文件即可发现,第一列数据为温度,单位K,温度梯度为50,第二列数据为自由能,单位KJ/mol,第三列数据为熵,单位J/K/mol,第四列数据为热容,单位为J/K/mol; (6) 将获得的thermal.dat文件...
Phonopy在Windows上的安装方法主要分为两种情况：使用Anaconda和不使用Anaconda。如果使用Anaconda： 安装步骤异常简单：只需访问Phonopy官网获取安装包，然后将安装包拖到Anaconda的shell中。 按照提示操作：输入相应命令后，根据shell中出现的提示进行确认和回车操作。 安装成功：当shell中出现安装成功提示时，表示...
Phonopy 是一个开源工具，专用于声子计算，支持谐波和准谐波分析。以下是其关键功能的概述：1. 安装Phonopy后，通过命令行输入可以验证其安装状态，用于处理特定材料，如mp-460，这是一种具有立方[公式]空间群结构的[公式]化合物。2. 扩展单元格的处理涉及定义原子移动的幅度，例如，通过`--dim="2 2 ...
方法/步骤 1 一.Anaconda4.2.0安装，这一部分下载安装很简单：下载安装网址：可以自己百度 ；二.phonopy的安装1、解压tar xzvf phonopy-1.9.3.tar.gz2、进入安装目录cd phonopy-1.9.33、安装python setup.py install --prefix=/gpfs/home/wjqiu/software/phonopy-1.9.34、vim ~/.bashrc文件export PYTHON...
使用Phonopy计算声子群速度时,q点处的群速度主要由标签GROUP_VELOCITY控制,群速度被写入yaml文件中,对应于笛卡尔坐标的运行模式。物理单位取决于输入文件的物理单位和频率转换因子,但是如果仅仅使用VASP和默认设置(例如,声子频率为THz),那么物理单位将是Angstrom THz。 操作步骤 (1) 首先对结构高精度优化后扩胞,计算得到...
phonopy -c POSCAR-unitcell -p -s band 通过上述命令,会输出名为 band.pdf 的文件。 改文件内容为: 注:如果在原点有负的频率,则需要提高原胞结构优化的精度; 注:如果在其他的地方有负的频率,则需要扩大超胞; 注:输出的文件 band.yaml 的内容是原子振动的信息,对应的数值除以 \rm \sqrt{M} 就是原子振...
若遇到生成FORCE_CONSTANTS文件困难，则需去掉注释部分。将每个计算目录job-*中的vasprun.xml文件复制到上级目录，改名并编号。接着，执行三条命令以获取二阶力常数矩阵FORCE_CONSTANTS和声子谱数据551.dat。声子谱数据551.dat可以导入OriginLab软件绘制，FORCE_CONSTANTS文件则可用于进一步计算晶格热导率。