氨基的质子化状态（默认为-NH3+）为-NH2，请问该如何操作，才能利用pdb2gmx命令，将pdb文件转为加氢后...
在下希望得到超高分子量(20000以上)的聚合物拓扑文件，自写了聚合物的单体残基的.rtp文件，先后尝试放到...
用的oplsaa立场，楼主补一个加氢的.rtp文件可以详细一点吗？用的oplsaa力场就不用自己补rtp文件了，用...
hdb文件里,第三行加氢的文本处 1 1 H1 C O CA 修改成H1