GO-MF结果显示,金丝桃苷和槲皮素主要通过与蛋白结合发挥作用(图1G、H)。KEGG通路富集结果显示,金丝桃苷和槲皮素均可作用于活性氧途径(图1I、J)。“金丝桃苷-靶点-通路”和“槲皮素-靶点-通路”显示,抗氧化相关基因主要参与Nrf2、...
然而,在Keap1缺乏的情况下,Bach1的缺失加剧了Nrf2报告基因的活性(图4A),这反映在Nrf2靶基因表达的增强上(图4B,C)。此外,GSEA显示,在Bach1 DKO中,多个特征的标准化富集得分更高,包括KEGG溶酶体特征;crkeap1a/b复合突变体相对于crkeap1a/b突变体幼虫(图1E,3A,4C和图S4B)。ß-gal染色证实Bach1 DKO溶酶体...
由于顺铂主要在近端小管上皮吸收,通过分离了肾小体和近端小管细胞分析。GO和KEGG的DEGs在能量代谢、氧化应激和凋亡途径中富集(图S4D,E)。分别分析了TM和顺铂组之间DEGs的上调和下调(图6B)。上调基因显示蛋白稳定性和氧化稳态升高(图6C),而下调基因显示TM治疗缓解了氧化应激和抗肿瘤药物的反应(图6D)。文章研究了肾...
KEGG通路富集结果显示,金丝桃苷和槲皮素均可作用于活性氧途径(图1I、J)。“金丝桃苷-靶点-通路”和“槲皮素-靶点-通路”显示,抗氧化相关基因主要参与Nrf2、MAPK和NF-κB信号通路(图1K和L)。 图1利用网络药理学方法预测了与金丝桃苷/槲皮素相互作用的可能靶点和途径 研究发现槲皮素对氧化损伤的保护作用可能优于...
GO-MF结果显示,金丝桃苷和槲皮素主要通过与蛋白结合发挥作用(图1G、H)。KEGG通路富集结果显示,金丝桃苷和槲皮素均可作用于活性氧途径(图1I、J)。“金丝桃苷-靶点-通路”和“槲皮素-靶点-通路”显示,抗氧化相关基因主要参与Nrf2、MAPK和NF-κB信号通路(图1K和L)。
为了确定脓毒症中显著改变的分子功能和信号通路,作者进行了基因本体(GO)和京都基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。与所有DEG(图2A)和上调基因(图2B)相关的KEGG通路表明,氧化磷酸化(OXPHOS,KO00190)在脓毒症中起着重要作用。与这些结果一致的是,在脓毒症中上调的基因的GO分子功能术语与氧化磷酸化相关功能有关,例如...
KEGG 分析表明,E2F2M-KO小鼠的 BMDMs 中富含糖酵解和葡萄糖生成通路(图 4A)。热图显示,在E2F2M-KO小鼠的BMDMs中,与糖酵解相关的基因表达上调,而与氧化磷酸化(OXPHOS)相关的基因表达下调(图4B)。此外,作者还注意到,在喂食高氟日粮的E2F2M-KO小鼠肝巨噬细胞中,糖酵解相关蛋白(Glut1 和 PKM2)的表达增加(图...
此外,根据KEGG分析结果,NF-κB通路可能参与了BMMs中Nrf2的调控(图5B)。染色质免疫沉淀测序结果显示,在Timp3基因内发现Nrf2 ChIP-seq峰。其中一个峰值位于启动子区域,其他峰值位于内含子或外显子内(图5C)。在LPS处理的BMMs中使用抗Nrf2...
Here, mRNA-sequencing analysis, along with KEGG and GO analyses, revealed that DEGs linked to Crizotinib-induced hepatotoxicity predominantly associate with the ferroptosis pathway which was identified as the principal mechanism behind Crizotinib-induced hepatocyte death. Furthermore, we found that ...
(KEGG) pathway analysis26for these 203 genes and found that several important pathways were associated with these genes (Fig. 3a). The pathways related to the inflammatory diseases were enriched in these genes, supporting the notion that Nrf2 contributes to the resolution of inflammation. These ...