这一过程被认为是由一批关键菌群成员驱动的,而不是驱动初级演替的“先锋微生物”(图1,第5-7栏)。第三阶段,最终的演替是宿主自然衰老和死亡的一部分。在衰老过程中,微生物群体演替速度加快,并且产生由更少微生物组成的群落。其中,变形菌门(如假单...
Holobiont共生功能体:一种植物及其相关微生物群的成员,被视为一个整体;这代表了植物与微生物组相互作用可能共同进化的“选择单位”,以便在生态甚至是进化的时间尺度上保持宿主功能和适应性。 Core microbiota核心菌群:微生物群中常见的一组微生物;微生物之间关联的重现性被用来作为选择微生物的标准,这些微生物可能在它...
植物相关的微生物组的选择性装配需要多种复杂的植物-微生物和微生物-微生物相互作用。显示了与定殖有关的微生物介导的过程,途径和蛋白质(代谢和运输;微生物间相互作用;趋化性和细胞运动;生物膜产生;效应子介导的定殖和应激反应)。在整个发育阶段,植物通过释放根系分泌物(例如有机酸,糖和次生代谢产物)与微生物组相...
这些微生物-统称为皮肤微生物群-是皮肤生理学和免疫力的基础。皮肤微生物和宿主之间的相互作用可以在共生和致病性之间的任何地方发生。此综述中,我们强调宿主-微生物如何很大程度上依赖于背景相互作用,包括免疫激活状态、宿主遗传易感性、屏障状态、微生物定位和微生物-微生物相互作用。 论文ID 原名:Skin microbiota–hos...
气候变化扰乱了物种之间的相互作用,迫使物种适应、迁移或被其他物种取代或灭绝。海洋变暖、酸化、富营养化和过度使用(例如捕鱼、旅游)共同导致珊瑚礁的衰退,并可能导致生态系统的改变。一般来说,微生物比宏观生物更容易分散。然而,许多微生物物种存在生物地理差异,扩散、生活方式和环境因素强烈影响群落组成和功能。海洋酸化...
导致这种屏障完整性破坏的宿主-菌群相互作用尚待确定。针对肠道共生体的先天性和适应性免疫反应也可能在肠道外部器官中发生。解剖学与肠道连接的器官(特别是胰腺和肝脏)最有可能直接受到肠道菌群及其产物的影响。从原始肠的胰腺解剖学发展导致腹膜后定位和与肠腔的功能性连接。这使得胰腺特别容易受到肠道微生物移位的影响...
功能团体(Functional guilds):使用相似资源(例如,电子供体、电子受体或碳源)并占据相似生态位的物种群。 关键种(Keystone species): 对维持微生物组的功能和微生物相互作用(微生物之间及与环境间)有特别大影响的物种。 通量平衡分析(Flux balance analysis):一种基于约束的数学建模技术,利用基因组信息重建代谢网络以模...
宿主-微生物相互作用的结果影响铁的系统水平、不同组织中的铁储存和宿主葡萄糖代谢。在宿主和微生物群之间的界面处,宿主先天免疫系统和调节铁的循环可溶性因子(即铁调素、脂质运载蛋白2和乳铁蛋白)的变化与代谢疾病相关。事实上,肥胖相关代谢功能障碍和胰岛素抵抗的患者表现出铁稳态失调和肠道菌群变化。从进化的角度来看...
肠道微生物组是所有年龄组中与衰老相关的健康损失和几种非传染性疾病的促成因素。一些与年龄和疾病相关的微生物组成和功能变化重叠,而另一些则截然不同。本篇综述探讨了针对老年人肠道微生物群的靶向研究以及跨越不同地理群体的一般队列研究。我们还致力于实现靶向恢复与健康衰老相关的微生物的承诺。 关键点 •肠道...
每个人都有独特的微生物组,每小时向周围环境释放31毫克的总颗粒质量、3700万个细菌基因组拷贝和700万个真菌基因组拷贝。同样,每个室内微生物组也是独一无二的。常规活动,即使看似微不足道,也会显著影响封闭空间内的微生物传播。空气流通,由建筑结构和操作管理决定,起着塑造室内环境微生物环境的关键作用。这些因素...