MSK-IMPACT™于2017年11月16日通过FDA批准,成为第一款通过审批检测组织多癌种多基因的大Panel 。 MSK-IMPACT 通过对肿瘤组织 FFPE 样本和 Normal 样本进行 Panel 捕获、NGS测序及生信分析检测,可以广泛检测基因组中的肿瘤基因突变。它采用的测序平台是Illumina HiSeq™ 2500 Sequencer (qualified by MSK),检测的...
只要一行下载命令,就可以尽情挖挖挖。 数据库网址: https://www.cbioportal.org/study/summary?id=msk_impact_2017 Step1.下载数据 wget http://download.cbioportal.org/msk_impact_2017.tar.gz tar -zvcf msk_impact_2017.tar.gz cd msk_impact_2017 Step2.过滤得到肝癌样本 Step3. 抓取primary-metastasis...
研究人员运用电子健康记录数据来搜索转移性疾病患者的信息，收集他们肿瘤转移的时间节点。结合MSK-IMPACT实体瘤检测平台记录的341-468个癌症基因和分子数据，使得比较原发性肿瘤和转移性肿瘤转移部位的分子特征成为可能。研究人员在文中写道：“我们的数据为研究转移扩散的生物学基础提供了宝贵的资源，并突出了染色体不稳定...
12017年的调查数据显示,超过75%的肿瘤学家使用二代测序(NGS)检测来指导癌症治疗。2NGS已成为将基因组测序应用于临床实践的宝贵工具。 2017年11月15日,FDA批准纪念斯隆-凯特林癌症中心(MSKCC)基于NGS技术的肿瘤多基因性能检测试剂MSK-IM...
MSK-IMPACT是美国著名的癌症中心— MSK-斯隆—的一个实体瘤检测平台。其研发者是Dr. Michael Berger,在肿瘤遗传学、计算机生物学和高通量测序等领域都非常有造诣的肿瘤遗传学家。之后,又在有CLIA认证(国际权威实验室认证机构)的分子病理实验室经过两年的全方位的优化与验证,于2014年获得所在州—纽约州—卫生局的批准...
MSK斯隆有自主的精准肿瘤数据库OncoKB。这个数据库由一组专家团队来维护,会根据FDA批准,NCCN指南,临床试验及发表的科研论文及时更新。数据库与MSK-IMPACT检测平台平行,对检测结果进行相应的标注,提示肿瘤科医生可选择的治疗药物。 迄今为止,这个数据库已经收集了将近700个基因的5...
MSK-IMPACT™于2017年11月16日通过FDA批准，成为第一款通过审批检测组织多癌种多基因的大Panel 产品。MSK-IMPACT 通过对肿瘤组织 FFPE 样本和 Normal 样本进行 Panel 捕获、NGS测序及生信分析检测，可以广泛检测基因组中的肿瘤基因突变。它采用的测序平台是Illumina HiSeq™ 2500 Sequencer (...
这189个变异均在比较高覆盖度、高等位基因频率的情况下被MSK-IMPACT检测到。见表s2a。胚系CNV突变分布于10个基因上,为基因水平的缺失或者单外显子的缺失/重复。使用44个样本数据重现了检测结果,即结果具有可重复性。见表s2b。 16个样本中检测到了除已知突变外的其他致病性胚系突变。其中两例样本新检测到2个突变,...
通过在州内开展IMPACT检测服务,MSK肿瘤中心向FDA递交了在2014年1月至2016年5月先后从大量肿瘤患者中收集到上万份肿瘤组织样本检测数据,并将向纽约州卫生局递交的申请文件及相应的审评审批文件一并提交给FDA。这些文件作为此次向FDA申请的证明性资料,可以加快FDA的审评审批进度。 在这个审评过程中,美国FDA也另辟蹊径...
研究人员运用电子健康记录数据来搜索转移性疾病患者的信息,收集他们肿瘤转移的时间节点。结合MSK-IMPACT实体瘤检测平台记录的341-468个癌症基因和分子数据,使得比较原发性肿瘤和转移性肿瘤转移部位的分子特征成为可能。 研究人员在文中写道:“我们的数据为研究转移扩散的生物学基础提供了宝贵的资源,并突出了染色体不稳定性...