进一步的选项,设置丰度cut off和是否只报道最高的匹配 根据离子模式选择脂质类型,溶剂与碰撞方式,选择存在的离子峰 设置参考QC样品,一般为QC样品,就是几种Sample的混合,那么所有峰都会根据这个样品来比对,然后设置RT和MS1的误差范围,设置RT和MS1的重要性因子,然后设置峰的过滤值,比如一共47个样品,最少要在9个QC样...
研究团队共同开发了一种非靶向的脂质组学平台,将它包装在MS-DIAL 4软件中,并符合脂质体标准倡议(LSI)半定量定义和脂质结构简写标记系统。同时结合离子迁移率MS/MS,提供了一个包含RT、CCS和其他MS信息的全面脂质组图谱。 通过表征生物样品中的脂质组信息,并根据实验数据而非计算机模拟进行配制,MS-DIAL 4覆盖范围优于...
研究团队共同开发了一种非靶向的脂质组学平台,将它包装在MS-DIAL 4软件中,并符合脂质体标准倡议(LSI)半定量定义和脂质结构简写标记系统。同时结合离子迁移率MS/MS,提供了一个包含RT、CCS和其他MS信息的全面脂质组图谱。 通过表征生物样品中的脂质组信息,并根据实验数据而非计算机模拟进行配制,MS-DIAL 4覆盖范围优于...
进一步的选项,设置丰度cut off和是否只报道最高的匹配 根据离子模式选择脂质类型,溶剂与碰撞方式,选择存在的离子峰 设置参考QC样品,一般为QC样品,就是几种Sample的混合,那么所有峰都会根据这个样品来比对,然后设置RT和MS1的误差范围,设置RT和MS1的重要性因子,然后设置峰的过滤值,比如一共47个样品,最少要在9个QC样...
可以。使用开源软件MS-DIAL对脂质进行定性和定量分析，因此是可以定性的。MS-DIAL是一款针对非靶向代谢组学的数据处理的第三方软件，最大的优势在于能够兼容来自不同仪器。
对于血浆脂质组学,经典的LLE法是Bligh-Dyer和Folch方法,它们基于氯仿和甲醇的混合物来提取脂质。其他方法,如Matyash法和Alshehry法,也已得到了开发。Matyash法使用甲基叔丁基醚(MTBE)代替氯仿。氯仿和MTBE都是两相萃取剂,可以将代谢物分离为亲水有机相...
可作为Lipidmaps分析的补充，Lipidmaps和Lipidblast是目前最常用的脂质组鉴定数据库。Lipidblast METLIN数据库 METLIN数据库由美国斯克里普斯研究院（Scripps Research Institute）开发的，包含超过96万种化合物，这些数据来自多个QTOF质谱检测平台，包括SCIEX、Agilent、Bruker、Waters。METLIN现在拥有超过500,000种分子标准品，...
该数据库使用计算机生成了78314个正离子模式数据和134202个负离子数据,同时也包含了多种加合离子的类型。可作为Lipidmaps分析的补充,Lipidmaps和Lipidblast是目前最常用的脂质组鉴定数据库。 Lipidblast METLIN数据库 METLIN数据库由美国斯克里普斯研究院(Scripps Research Institute)开发的,包含超过96万种化合物,这些数据...
Lipidmaps数据库由美国国立卫生研究院(NIH) 创立的脂质数据库,是目前权威的脂质数据库,收录超过4万种脂质的结构、谱图和分类信息。Lipidmaps根据脂质的结构和功能,将脂质分为8大类,脂肪酸类(Fatty Acyls),甘油脂类(Glycerolipids),甘油磷脂类(Glycerophospholipids),鞘脂类(Sphingolipids),固醇类(Sterol Lipids),异戊...
Lipidmaps数据库由美国国立卫生研究院(NIH) 创立的脂质数据库,是目前权威的脂质数据库,收录超过4万种脂质的结构、谱图和分类信息。Lipidmaps根据脂质的结构和功能,将脂质分为8大类,脂肪酸类(Fatty Acyls),甘油脂类(Glycerolipids),甘油磷脂类(Glycerophospholipids),鞘脂类(Sphingolipids),固醇类(Sterol Lipids),异戊...