miRNA和mRNA是两种不同的RNA类型,具有不同的功能和结构。 miRNA是一种非编码RNA,其长度通常在21-25个核苷酸之间。miRNA可以通过抑制mRNA的翻译或降解mRNA来调节蛋白质的表达水平。miRNA在生物体内扮演着重要的调节基因表达的作用,参与了许多生物学过程,如细胞周期、细胞分化、细胞凋亡等。mRNA是一种编码RNA,其长度通常...
示例结合分析: microRNA.org: 预测已知mRNA结合的miRNA:以H19为例 1. 打开主页面 2. 点击“targetmRNA”,对话框输入h19,选择种属 3. 点击“GO”,即可获取得到预测结合的miRNA 已知miRNA,查询该miRNA调控的mRNA:以mir-9为例 1. 打开主页面 2. 点击“miRNA”,对话框输入miR-9,选择种属 3. 点击“go”,即...
精神分裂症mRNA/微小核糖核酸网络生物信息学目的探索精神分裂症患者外周血中mRNA/微小核糖核酸(miRNA)网络综合分析.方法纳入2022年12月至2023年2月就诊于该院的精神分裂患者6例作为实验组,志愿者4例作为对照组.收集两组人群血液样本,采用RNA-seq技术检测mRNA及miRNA的表达水平.最后利用基因表达综合数据库中GSE145554基因...
本方法用于分析miRNA与mRNA之间的相互关系,miRNA与mRNA来源于同一个实验中差异表达的miRNA与差异表达的mRNA。该方法包括如下几个步骤步骤一、miRNA与mRNA表达谱相关性分析。步骤二、靶基因Gene Ontology分析。步骤三、靶基因pattiway分析。步骤四、基因网络分析。步骤五、miRNA-mRNA网络分析。以上方法可分析出miRNA与mRNA之...
缓解DBP诱导的细胞氧化应激损伤。证实了miR-135b-5p可通过负调控USP15减弱DBP诱导的氧化应激损伤。因此，我们推测USP15抑制介导的Keap1/Nrf2泛素化途径的改变可能是机体对DBP引起的睾丸氧化还原状态失衡的自我保护机制。本研究的miRNA和mRNA测序及分析由上海派森诺生物科技有限公司完成。
文章的分析流程如下图: 注解:NICM:非缺血性;ICM缺血性;NF:正常样本;pre-LVAD:植入辅助装置前;post-LVAD:植入辅助装置后。 1 转录组分析后发现,心脏的mRNA和lncRNA中分别有37%和71%比例的来自线粒体DNA。而miRNA则不同,所有miRNA都来自非线粒体。
基迪奥成立至今一直致力于为广大科研工作者提供高通量测序服务,王牌产品众多,基于miRNA的联合分析就是其中一份,除了关联mRNA和ncRNA,其他组学的加入,更加丰富了经典的miRNA调控研究内容。今天为大家带来的文章是基迪奥客户近期发表的miRNA+转录组+脂质组联合分析一篇高分好文。
那篇文章分析的不够细致,我这里选择了浙江大学的一篇TCGA数据挖掘分析文章Identifying miRNA/mRNA negative regulation pairs in colorectal cancer,里面首先就是查找miRNA-mRNA基因对,因为miRNA主要还是负向调控mRNA表达,所以根据我们得到的两个表达矩阵做相关性分析,很容易得到符合统计学意义的miRNA-mRNA基因对,具体分析...
因此,收集现有公开的亚洲人AD与正常人mRNA/miRNA表达谱数据,通过生物信息学手段,筛选核心差异基因与差异miRNAs,构建miRNA-mRNA的差异表达网络。从转录组水平系统的对亚洲人群可能的AD发生机制进行分析,为亚洲人AD的诊疗提供新的潜在靶标。 1 材料与方法分析流程主要包含以下环节:数据收集与下载,数据集预处理与单个数据集...
作为动物产后生长研究的理想模型,巴马小型猪相较于大型猪具有较低的生长性能和较少的个体差异。在本项研究中,华南农业大学张永亮教授领衔的课题组采用miRNA芯片和mRNA-Seq对巴马小型猪和长白猪垂体前叶的miRNA和mRNA表达谱进行了关联分析(miRNA表达谱芯片分析由联川生物承担完成)。