cfDNA液体活检中研究得最为深入的分支是ctDNA在肿瘤诊疗中的应用。 ctDNA (circulating tumor DNA)即 循环肿瘤DNA片段,指的是由肿瘤细胞释放到外周血液循环的小片段DNA。即使在一个典型肿瘤患者中ctDNA占总cfDNA的比例不到1%,目前的测序技术也已经允许检测其所携带的肿瘤基因组信息了。另外,与CTCs( 循环肿瘤细胞(ci...
ctDNA(circulating tumor DNA)即循环肿瘤DNA片段,指的是由肿瘤细胞释放到外周血液循环的小片段DNA。即使在一个典型肿瘤患者中ctDNA占总cfDNA的比例不到1%,目前的测序技术也已经允许检测其所携带的肿瘤基因组信息了。另外,与CTCs(循环肿瘤细胞(circulating tumorcells),指脱离于实体瘤并进入外周血液循环的肿瘤细胞)相比,...
MRD的性能评估,检出限与灵敏度同等重要。cfDNA输入量、追踪的体细胞突变数量、测序深度等是影响MRD检测LoD/分析灵敏度的关键参数。 cfDNA输入量并不是越多越好,要结合样本/患者情况。在相同的血浆游离DNA(cfDNA)输入量下,在一定范围内,增加追踪突变数量及测序深度可提升MRD检测灵敏度。推荐追踪多个突变,测序深度推荐>3...
cfDNA输入量、追踪的体细胞突变数量、测序深度等是影响MRD检测LoD/分析灵敏度的关键参数。cfDNA输入量并不是越多越好,要结合样本/患者情况。在相同的血浆游离DNA(cfDNA)输入量下,在一定范围内,增加追踪突变数量及测序深度可提升MRD检测灵敏度。推荐追踪多个突变,测序深度推荐>30000x,个性化定制panel测序深度可考虑>100000...
内部通过使用 8 个和 24 个已知阳性位点的两种 cfDNA 标准品进行批间和批内测试,搭配全流程配套建库捕获试剂以及生信分析流程,位点检出率及稳定性均处于较高水平。同时,此批次实测数据也可看出,检测位点增加,在样本投入量减少的情况下,检出率也可得...
循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)是肿瘤细胞凋亡后进入血液的游离DNA,是cfDNA的一种,其监测或能更早预测疾病复发2。 目前被广泛认可的是,通过ctDNA检测来预测MRD,因此,本文主要提及的是ctDNA。 MRD的用途 中山大学肿瘤防治中心陈功教授...
与之相对的有cfDNA,全称Circulating-free cell DNA,即循环游离细胞DNA,它是由人体细胞释放到血液等体液中的游离状态DNA。简单来说就是正常细胞也会向血液中释放DNA,其与肿瘤细胞释放的DNA合在一起统称cfDNA,这是一个非常重要的概念,请务必记住并理解。 由于血液具有流动性,ctDNA在血液中的分布并不是均匀的,可能...
1. ctDNA含量低,并且常规方法不能与cfDNA进行分离 2. ctDNA突变丰度低,需要灵敏度极高的检测方法 01检测内容 02检测优势 ☞全流程提高检测灵敏度 桐树基因依托ctDNA核心技术搭建全平台式检测,从ctDNA抽提、文库构建、靶向富集、生信分析等全流程提高ctDNA检测灵敏度。
当癌细胞死亡时,它们会释放DNA到血液中。通过收集血液样本中的所有cfDNA,可以对样本进行癌细胞标志物分析,以确定患者体内是否仍有癌细胞存在。 目前有两种检测MRD的方法,肿瘤知情分析(Tumor-informed 路径)和肿瘤不知情分析(Tumor-naive 路径),前者需要组织结果作为参考或定制panel,后者仅需分析血浆ctDNA的变异情况。
但是,血液中除存在ctDNA外,还有大量的细胞游离DNA (cell-free DNA, cfDNA),其中绝大部分来自正常细胞,只有极少数来自肿瘤细胞;因此,我们需要一个成熟的技术,以精准的手段才能将这些低频的信号捕获并有效鉴别出来。 所幸,基因检测技术在近年来飞速发展,已有少数基因检测公司具备了这样的技术,可以通过抽血行ctDNA深度测...