输出位置: 默认值为 meme_out/目录。如果这个目录不存在,会新建一个。输出的文件会有meme.html,meme.xml, meme.txt, meme.xsl以及一些LOGO图片。当然你也可以设置输出的位置。 -o 输出目录名;如果已经存在的话不覆盖该目录; -oc 输出目录名;如...
meme分析motif输入和输出数量不一致 meme分析motif步骤 MEME(Motif-based sequence analysis tools)使用说明 MEME是用于从一堆序列中搜索功能结构域的工具。比如说当你拿到了许多CHIP-chip或者CHIP-seq的数据,当分析出峰所处的位置之后可以得到一些这些峰所代表的序列,这就是蛋白质与DNA相到作用所保护下来的片段。所以...
获取MOTIF 位置信息矢量图 MEME(Motif-based sequence analysis tools)大家都很了解,是搜索DNA或者蛋白质的motif常用工具,结果输出一般是有四个文件,motif的图形展示文件(LOGO),txt文本,html的网页信息文件及xml... MEME(Motif-based sequence analysis tools)大家都很了解,是搜索DNA或者蛋白质的motif常用工具,结果输出...
MEME(Motif-based sequence analysis tools)使用说明MEME是用于从一堆序列中搜索功能结构域的工具。比如说当你拿到了许多CHIP-chip或者CHIP-seq的数据,当分析出峰所处的位置之后可以得到一些这些峰所代表的序列,这就是蛋白质与DNA相到作用所保护下来的片段。所以使用MEME搜索其中非常相似的序列片段就可能是有一定功能的...
很多情况下我们需要对该图片做进一步处理或者直接置于文章中但该图片无法直接保存而截图获得的并是不矢量图在后续应用中可能会有麻烦 获取MOTIF位置信息矢量图 MEME(Motif-based sequence analysis tools)大家都很了解,是搜索DNA或者蛋白质的motif常用工具,结果输出一般是有四个文件,motif的图形展示文件(LOGO),txt文本,...
MEME motif-based sequence analysis tools (http://meme-suite.org), with FreeBSD tweaks - cinquin/MEME
(4.3) Motif analysis sequence MEME motif based sequence analysis tools meme-suite.org/ HOMER Software for motif discovery and next-gen sequencing analysis homer.ucsd.edu/homer/mo structure RNApromo Computational prediction of RNA structural motifs involved in post transcriptional regulatory processes genie...
DREME is available as part of the MEME Suite of motif-based sequence analysis tools (http://meme.nbcr.net).Contact: t.bailey@uq.edu.auSupplementary information: Supplementary data are available at Bioinformatics online.BaileyInstitute for Molecular BioscienceTimothy L....
transcription-factorstranscription-factor-bindingpwmmotif-discoverymotif-analysis UpdatedFeb 17, 2025 Ruby Estimating Phylogenetic trees using six microorganisms 16S rRNA gene with Unsupervised Learning, web based tools and Molecular Evolutionary Genetics Analysis MEGA7 ...
The MEME suite is the most complete collection of tools for discovery and analysis of sequence motifs. It offers a set of different programs organized in a web server interface to let users perform five types of motif-based analysis. 1) De novo motif discovery on a set of sequences. 2) ...