简而言之,mixOmics主要有三种分析模式: (1)在面对单类组学数据时,可以使用PCA,sPCA进行降维以及特征筛选,而面对有监督的数据类型时,可以转而使用PLS-DA,sPLS-DA在考虑样本分类信息的情况下将样本投射到低维空间中并进行分析。 (2)而面对多种不同类型组学数据时,可以使用N-集成(DIABLO)将不同数据联合起来,例如基...
r包mixomics进行微生物群落偏最小二乘判别分析pls da早期.pdf,R 包 mixOmics 进行微生物群落偏最小二乘判别分析(PLS-DA ) 在代谢组学分析中经常可以见到主成分分析(PCA )、偏最小二乘判别分析(PLS-DA ) 等分析 ,目的为区分样本差异,或在海量数据中挖掘潜在标志物。P
简而言之,mixOmics主要有三种分析模式: (1)在面对单类组学数据时,可以使用PCA,sPCA进行降维以及特征筛选,而面对有监督的数据类型时,可以转而使用PLS-DA,sPLS-DA在考虑样本分类信息的情况下将样本投射到低维空间中并进行分析。 (2)而面对多种不同类型组学数据时,可以使用N-集成(DIABLO)将不同数据联合起来,例如基...