ChIP-seq研究蛋白质与DNA的相互作用,其motif预测分析主要是寻找转录因子等蛋白质在DNA上的结合位点motif;RIP-seq研究RNA结合蛋白与RNA的相互作用,其motif预测分析是寻找RNA结合蛋白在RNA上的结合位点motif。 2.3 分析意义的区别 ChIP-seq的motif预测分析可用于研究基因转录调控、染色质状态和基因组结构等,帮助构建基因调...
51CTO博客已为您找到关于MEME结果解读的相关内容,包含IT学习相关文档代码介绍、相关教程视频课程,以及MEME结果解读问答内容。更多MEME结果解读相关解答可以来51CTO博客参与分享和学习,帮助广大IT技术人实现成长和进步。
MEME motif结果解读 数据库 应用程序 Test 转载 数据科学家 2月前 31阅读 MEME中的motif分析结果怎么看 meme怎么做motif分析 MEME是用于从一堆序列中搜索功能结构域的工具。比如说当你拿到了许多CHIP-chip或者CHIP-seq的数据,当分析出峰所处的位置之后可以得到一些这些峰所代表的序列,这就是蛋白质与DNA相到作...
MEME suite是一个motif挖掘和分析工具。在大多数情况下,我们会使用它从批量数据中鉴定出某些保守的motif,比如Chip-seq;当然,我们也会使用某个特定的motif,去海量的序列中,查找可能包含该motif的序列,比如转录因子结合位点或特定元件。 写在前面 Emm...生物信息,应是一门完整的学科。而整个市场在批量生产生信工程师,...
常见的应用场景是根据chip_seq等数据获取到的peak序列,挖掘这些序列中存在的模式特征。以 MEME 为例,输出结果示意如下 2. Motif Enrichment 这部分工具用于分析已知的motif在输入序列上的富集情况,包含的工具列表如下 CentriMo AME SpaMo GOMo 常见的应用场景是根据ATAC_seq的peak序列,分析在这些序列中出现富集的已知mo...
MEME是用于从一堆序列中搜索功能结构域的工具。比如说当你拿到了许多CHIP-chip或者CHIP-seq的数据,当分析出峰所处的位置之后可以得到一些这些峰所代表的序列,这就是蛋白质与DNA相到作用所保护下来的片段。所以使用MEME搜索其中非常相似的序列片段就可能是有一定功能的结构域。
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