Materials Studio官方教程:DMol3——计算简单化学反应的势垒【1】 Materials Studio是久负盛名计算模拟软件,问世20余年来,经过不断地迭代优化,使其功能异常强大,极易上手,初学者只需通过简单的参数设置和点击鼠标就能完成DFT计算。其计算可靠性久经考验,备受Nature、Science等顶级期刊认可。 华算科技和Materials Studio官...
前提条件:利用LST/QST工具搜索过渡态(Transition-state searching using LST/QST tools)教程 背景 本教程基于Diels-Alder乙烯(C2H4)与丁二烯(C4H6)的反应: 该反应具有大量的衍生物,通常生成六元环,因此具有实用价值。该反应及其逆反应(retro Diels-Alder反应)已被广泛研究,并已确定(除反应的高度立体异构性之外)其机理...
注意:为了和本教程中的参数保持一致,可以使用Settings Organizer对话框将项目中所有参数都设置为BIOVIA的默认值。 1、开始 首先启动Materials Studio并创建一个新项目。 打开New Project对话框,输入kinetics作为项目名,单击OK按钮。 新项目将以kinetics为项目名显示于Project Explorer中。 2、准备计算结构模型 建立反应物和...
我们将展示如何使用Materials Studio中DMol3模块进行分子动力学计算,从动力学的角度来评价催化剂理论模型在一定温度下的结构稳定性。 操作步骤 (1)优化催化剂结构;我们以CoN4内嵌石墨烯的模型为例,首先构建如下的结构,然后选择合适的参数进行结构优化,得到稳定的结构。 (2)动力学计算;选择优化后结构的.xsd文件,点击DMo...
[DMol3公开课] 计算能带和态密度/能带结构分析/DOS和PDOS分析 | 华算科技-MS杨站长 31:10 [Forcite]1-寻找分子在表面上的低能构型 | Materials Studio官方课堂 | MS杨站长华算科技 28:11 [Forcite]2-分子动力学力场编辑 | Materials Studio模块教学 | MS杨站长 华算科技 38:12 [Forcite]3-气体分子在...
Materials Studio官方教程:DMol3——反应动力学【1】 3、创建反应轨迹 如果利用DMol3执行过渡态搜索,反应物和产物的所有原子都必须配对。这可以通过使用Tools菜单中的反应预览(Reaction Preview)功能实现。 首先,应将反应物和产物的结构并列显示。 打开ButadieneEthene.xsd和Cyclohexene Forcite GeomOpt\Cyclohexene.xsd文档。
将Kinetics.xod文件打开为当前文档,打开DMol3 Analysis对话框,并选择Reaction kinetics。将温度范围设置为From 200.0 K To 1000.0 K。取消勾选Apply tunneling correction选项卡,单击Calculate按钮。 将产生一个数据表,包含反应速率Arrhenius方程的参数: 计算出的参数可与从分解反应的激波管实验(Tsang, 1965)获得的实验值...
打开DMol3 Calculation对话框,在Setup选项卡中,将Task更改为TS Search。确保Quality设置为Medium,将Functional设置为m-GGA和M11-L,勾选Spin unrestricted复选框。 单击More...按钮,打开DMol3 Transition State Search对话框。确保Searchprotocol设置为Complete LST/QST,将Quality设置为Medium。勾选Optimizereactants and pro...
Materials Studio官方教程:DMol3——反应动力学【1】 3、创建反应轨迹 如果利用DMol3执行过渡态搜索,反应物和产物的所有原子都必须配对。这可以通过使用Tools菜单中的反应预览(Reaction Preview)功能实现。 首先,应将反应物和产物的结构并列显示。 打开ButadieneEthene.xsd和Cyclohexene Forcite GeomOpt\Cyclohexene.xsd文档。