为了解决LRR-RLK基因树问题,我们开发了一种基于迭代隐马尔可夫模型搜索和系统发育推断的改进基因发现方法。我们使用这种方法推断每个LRR-RLK亚类的完整基因树,并重建了整个基因家族的最深节点。 我们发现LRR-RLK基因家族比以前认为的还要大,并且蛋白质域的增益和损失非常普遍。这些结构修饰,其中一些可能早于有胚植物的多...
本文首先通过生信分析鉴定疫霉菌基因组中均编码蛋白结构与植物LRR-RLK相似的LRR-RLK基因亚家族,发现相比于植物,疫霉菌LRR-RLK具有具有胞外域相对较短,LRR motif数量较少,激酶区与植物激酶独立进化的特点。利用CRISPR/Cas9基因编辑技术对大豆疫霉菌24个LRR-RLK(PsRLK)的生物学功能进行系统分析,发现LRR-RLK基因亚家族在...
【目的】从苹果全基因组中鉴定LRR-RLK家族蛋白成员,并进行生物信息学和表达模式分析,为研究苹果LRR-RLK的潜在功能提供理论基础。【方法】利用BLASTp基于GDR数据库鉴定苹果LRR-RLK家族成员,通过ExPASy Proteomics Server、Cell-PLoc、CD-Search Tool、MEGAX、MG2C等软件分析LRR-RLK蛋白序列基本信息、亚细胞定位情况、结构...
杨树LRR-RLK基因家族的生物信息学分析及木材发育相关基因的克隆 Populus LRR-RLK gene family bioinformatic analysis and cloning of genes involved in vascular development 学科专业：食品科学 研究生：袁炜 指导教师：王洁华副教授 天津大学化工学院 二零一二年十二月 ...
在基因表达检测应用中，荧光标记的探针常常是通过反转录酶催化cDNA合成RNA，在这一过程中掺入荧光标记的核苷酸。用于检测基因表达的RNA探针还可通过RNA聚合酶线性扩增克隆的cDNA获得。在cDNA芯片的杂交实验中，杂交温度足以除DNA中的二级结构，完整的单链分子（300-3000nt）的混合物可以提供很强的杂交信号。...
植物抗性育种是植物抵抗病原菌最有效方法之一.RLK基因家族中有不少未被鉴定出的抗病基因.富亮氨酸受体激酶家族(LRR-RLK)是RLK基因家族中的一大亚族.对LRR-RLK基因家族功能和进化模式,机制的研究将对植物抗病基因和其它功能基因合理,高效的利用具有十分重要的意义.本文首次从拟南芥,水稻,葡萄,杨树四个基因组的范围,系...
LRR-RLK是植物类受体蛋白激酶家族(RLK)中最大的亚家族.该亚家族基因在调控植物体生长发育和抗逆性方面发挥重要作用.At1 g09970是LRR-RLK亚家族成员.通过PCR和RT-PCR在DNA和RNA水平上筛选鉴定At1 g09970对应的T-DNA插入失活的突变体.对萌发和萌发后阶段进行突变体的表型分析结果表明,At1 g09970突变体在萌发后对NaCl...