我们发现LRR-RLK基因家族比以前认为的还要大,并且蛋白质域的增益和损失非常普遍。这些结构修饰,其中一些可能早于有胚植物的多样化,导致某些LRR-RLK变体被错误归类为其他基因家族的成员。我们的工作纠正了这种错误分类。我们的结果揭示了正在进行的结构演化,产生了新的LRR-RLK基因。这些新基因是发育和防御中信号多样化的原材料。我们
本文首先通过生信分析鉴定疫霉菌基因组中均编码蛋白结构与植物LRR-RLK相似的LRR-RLK基因亚家族,发现相比于植物,疫霉菌LRR-RLK具有具有胞外域相对较短,LRR motif数量较少,激酶区与植物激酶独立进化的特点。利用CRISPR/Cas9基因编辑技术对大豆疫霉菌24个LRR-RLK(PsRLK)的生物学功能进行系统分析,发现LRR-RLK基因亚家族在...
【目的】从苹果全基因组中鉴定LRR-RLK家族蛋白成员,并进行生物信息学和表达模式分析,为研究苹果LRR-RLK的潜在功能提供理论基础。【方法】利用BLASTp基于GDR数据库鉴定苹果LRR-RLK家族成员,通过ExPASy Proteomics Server、Cell-PLoc、CD-Search Tool、MEGAX、MG2C等软件分析LRR-RLK蛋白序列基本信息、亚细胞定位情况、结构...
【结论】苹果LRR-RLK基因家族包含378个成员,进化上可分为15组,在17条染色体上均有分布,多数基因具有在茎中高表达的组织表达特征,多数基因受逆境和轮纹病菌调控。 关键词:苹果;LRR-RLK;基因家族;鉴定;表达分析 Abstract 【Objective】 The study was carried out to explore the whole genome characteristics and e...
在基因表达检测应用中，荧光标记的探针常常是通过反转录酶催化cDNA合成RNA，在这一过程中掺入荧光标记的核苷酸。用于检测基因表达的RNA探针还可通过RNA聚合酶线性扩增克隆的cDNA获得。在cDNA芯片的杂交实验中，杂交温度足以除DNA中的二级结构，完整的单链分子（300-3000nt）的混合物可以提供很强的杂交信号。...
MG2C 等软件分析 LRR-RLK 蛋白序列基本信息,亚细胞定位情况,结构域组成,系统 进化关系以及染色体定位情况.利用实时荧光定量 PCR 技术检测苹果 12 个 LRR-RLK 的组织表达和诱导表达特性.【结果】苹果 LRR-RLK 基因家族包含 378 个成员,这些 LRR-RLK 蛋白包括 318—1 827 个不等的氨基酸残基,等电点分布在 5.16...