tpm(transcripts per million)是一种常用的RNA-seq表达量数据单位,用于将基因表达量进行标准化,使得不...
❝本节来介绍一个做生存分析的新包「ggsurvfit」,完美兼容「ggplot2」语法;下面来简单介绍一下,...
使用TCGA-LIHC数据集,未进行任何样本过滤。 load("D:/data/TCGA/TCGAbiolinks-EXP/TCGA-LIHC-GeneSymbol.Rdata") expr_eset <- log2(exp_TPM + 0.1) expr_eset <- expr_eset[apply(expr_eset,1,sd) > 0.5,] #dim(expr_eset) library(IOBR) ###Method: ESTIMATE res_estimate <- deconvo_tme(eset...
董事长是不是有点奶狗系男友那味儿#国博文 #听泉 董事长是不是有点奶狗系男友那味儿#国博文 #听泉 84 谁懂啊真的很爱看他吃饭#听泉鉴宝直播回放 #听泉赏宝 谁懂啊真的很爱看他吃饭#听泉鉴宝直播回放 #听泉赏宝 19 想要一个全是表情包的评论区@博文加点油🙂↔️ @听泉赏宝 #听泉赏宝 #国博...
tpm(transcripts per million)是一种常用的RNA-seq表达量数据单位,用于将基因表达量进行标准化,使得不同基因和不同样本之间的表达量具有可比性。tpm值的计算依赖于基因的长度和对齐的reads数,不同于简单的counts值或者log2(x+1)转换。因此,vst转换无法直接应用于tpm数据。 然而,在一些情况下,可以考虑使用vst转换来...